201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0406 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  100 
 
 		 165 aa  333  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  92.73 
 
 		 165 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  87.88 
 
 		 165 aa  294  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  61.82 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  58.64 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  53.94 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  58.02 
 
 		 166 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  56.36 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  55.76 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  52.44 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  56.17 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  52.73 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  56.02 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  56.63 
 
 		 163 aa  180  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  56.02 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  52.44 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  55.62 
 
 		 168 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  56.25 
 
 		 168 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  51.83 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  51.83 
 
 		 166 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  53.94 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  60.61 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  50.91 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  56.69 
 
 		 168 aa  174  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  56.25 
 
 		 168 aa  174  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  52.17 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50.61 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  50.91 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  55.21 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  54.6 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  54.6 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  54.37 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  55.15 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  48.78 
 
 		 165 aa  163  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  47.88 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  49.69 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  50.97 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  46.59 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  48.17 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.27 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  46.58 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  46.95 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  45.34 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.79 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  45.34 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  43.03 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  42.86 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.62 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  44.94 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  42.86 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  51.85 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.57 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  43.26 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  44.94 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  44.94 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  42.11 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  44.3 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  43.83 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.14 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  41.67 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  39.77 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  43.56 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  42.42 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  37.85 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  40.85 
 
 		 178 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  44.58 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  40.85 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.85 
 
 		 233 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  42.68 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  45.83 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  45.83 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  45.83 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  48.46 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.04 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  39.63 
 
 		 392 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  40.61 
 
 		 221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.88 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  49.23 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  49.23 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  48.48 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  36.36 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  49.22 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  42.94 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  43.45 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  35.59 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  41.92 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  35.93 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  46.92 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  46.92 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  37.21 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  37.21 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  43.45 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  47.66 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  46.92 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  46.92 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.45 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  46.15 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  36.72 
 
 		 263 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  48.46 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>