More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0391 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
608 aa  1236    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 
615 aa  638    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.17 
 
 
638 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.5 
 
 
602 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  96.52 
 
 
604 aa  1190    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.95 
 
 
607 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.25 
 
 
640 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.68 
 
 
643 aa  744    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.14 
 
 
656 aa  661    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.57 
 
 
651 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.83 
 
 
639 aa  658    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  99 
 
 
499 aa  1001    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  53.33 
 
 
637 aa  631  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.97 
 
 
611 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.51 
 
 
653 aa  625  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  54.29 
 
 
656 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.12 
 
 
657 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.17 
 
 
616 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 
639 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.06 
 
 
614 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.32 
 
 
608 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.46 
 
 
620 aa  618  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.85 
 
 
632 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  52.14 
 
 
627 aa  616  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.09 
 
 
635 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  53.87 
 
 
654 aa  616  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 
685 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
676 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.73 
 
 
608 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.25 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.4 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  52.07 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  51.91 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  51.91 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.52 
 
 
630 aa  611  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 
621 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  51.91 
 
 
633 aa  611  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  51.66 
 
 
682 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.49 
 
 
672 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50.58 
 
 
665 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.57 
 
 
651 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  51.57 
 
 
693 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.8 
 
 
679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.36 
 
 
759 aa  600  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.5 
 
 
753 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.94 
 
 
682 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.08 
 
 
673 aa  599  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
637 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  52.43 
 
 
645 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
614 aa  597  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  61.81 
 
 
753 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
612 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
630 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.91 
 
 
743 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.96 
 
 
599 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
612 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
656 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 
619 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.66 
 
 
659 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 
630 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50.58 
 
 
639 aa  594  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
617 aa  594  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.98 
 
 
672 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  49.17 
 
 
700 aa  588  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.33 
 
 
638 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 
610 aa  592  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.18 
 
 
681 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  51.54 
 
 
662 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.17 
 
 
640 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.43 
 
 
645 aa  592  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
610 aa  589  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
617 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 
647 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.66 
 
 
637 aa  588  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.22 
 
 
697 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.47 
 
 
660 aa  587  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.54 
 
 
798 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.69 
 
 
684 aa  588  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
636 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 
616 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 
701 aa  586  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
601 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.92 
 
 
601 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
635 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.22 
 
 
697 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 
669 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  49.5 
 
 
764 aa  588  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.36 
 
 
669 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.83 
 
 
652 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.76 
 
 
635 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.32 
 
 
687 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.23 
 
 
783 aa  583  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  50.76 
 
 
635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.76 
 
 
635 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  50.25 
 
 
681 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>