199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0350 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0350  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000144824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_290  ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000295675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0329  30S ribosomal protein S21  100 
 
 		 64 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000310011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2659  30S ribosomal protein S21  51.56 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1056  ribosomal protein S21  65.12 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4355  30S ribosomal protein S21  53.7 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2770  30S ribosomal protein S21  53.7 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1774  30S ribosomal protein S21  55.56 
 
 		 57 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0129  ribosomal protein S21  53.7 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000000381308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0590  30S ribosomal protein S21  48.15 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2094  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0995026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0744  30S ribosomal protein S21  45.16 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  9.79578e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1348  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000370973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4292  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.78077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2490  ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2051  ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  49.09 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1268  30S ribosomal protein S21  46.3 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  41.51 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1335  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.563178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000157507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  38.71 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  49.02 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3215  ribosomal protein S21  40.82 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603816  hitchhiker  0.00000000377258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  49.02 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  49.02 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1330  30S ribosomal protein S21  44.68 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233824  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  46.77 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  49.02 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0008  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3426  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3749  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  49.02 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1451  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0105  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.759736  normal  0.539683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3830  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2325  SSU ribosomal protein S21P  43.14 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  0.0150528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2473  30S ribosomal protein S21  38.1 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000983176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2987  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0718  SSU ribosomal protein S21P  44.19 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2609  30S ribosomal protein S21P  45.45 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1344  30S ribosomal protein S21  44.44 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000177604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000159667  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  47.06 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000339059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0759  30S ribosomal protein S21  44.19 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  43.14 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000123882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000763372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000285201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000276369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  42.31 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000026344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2363  30S ribosomal protein S21  41.18 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  45.1 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000248235  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100201  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4533  ribosomal protein S21  42.59 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.309152 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  43.55 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000476189  normal  0.236523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>