38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0043 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0043  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000220124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0039  hypothetical protein  89.06 
 
 		 64 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_42  hypothetical protein  92.45 
 
 		 64 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000133403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1622  hypothetical protein  56.36 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.877447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1348  hypothetical protein  51.02 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.195078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1576  immunity protein, putative  56.52 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1591  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000431403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0943  hypothetical protein  65.12 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.654642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0962  putative immunity protein  46.15 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0870  putative immunity protein  46.15 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2212  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00311977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2624  hypothetical protein  51.02 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  hitchhiker  0.0000135778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4104  hypothetical protein  59.09 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3368  hypothetical protein  51.85 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5458  hypothetical protein  41.82 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6998  putative signal peptide transmembrane protein  47.73 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1567  putative immunity protein  44.64 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0224481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5275  hypothetical protein  46 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124042  normal  0.0618607 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0053  putative immunity protein  44.64 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.013055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1540  hypothetical protein  41.18 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1865  hypothetical protein  41.18 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.312869  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0833  putative immunity protein  44.64 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2874  putative signal peptide transmembrane protein  43.4 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5534  putative signal peptide transmembrane protein  38.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0776  hypothetical protein  41.3 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43126  normal  0.0318592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3697  hypothetical protein  42.55 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571902  normal  0.383858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5371  hypothetical protein  36.51 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.059612  normal  0.0608107 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4915  hypothetical protein  36.51 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424589  normal  0.380404 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3451  hypothetical protein  36.51 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.22431  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2536  hypothetical protein  46.34 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4350  hypothetical protein  43.48 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000333846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2920  hypothetical protein  46.34 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.371621  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4866  hypothetical protein  41.3 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  hitchhiker  0.000131644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1149  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1762  immunity protein, putative  38.46 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0454984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4324  hypothetical protein  44.19 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5164  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12060  hypothetical protein  45.65 
 
 		 81 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>