152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0033 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  95.22 
 
 
219 aa  410  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  93.3 
 
 
209 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  47.09 
 
 
204 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  44.39 
 
 
205 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  44.88 
 
 
205 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  42.44 
 
 
205 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  41.46 
 
 
205 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  41.46 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  43.41 
 
 
205 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  43.41 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  41.26 
 
 
212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  41.95 
 
 
209 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  39.34 
 
 
208 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  39.71 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  40.2 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  38.92 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  38.92 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  37.44 
 
 
208 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  36.27 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  38.42 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  36.95 
 
 
208 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  37.93 
 
 
208 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  38.92 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  40.29 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  38.24 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  38.92 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  36.45 
 
 
208 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  37.44 
 
 
208 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  40.69 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  36.71 
 
 
205 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  38.83 
 
 
211 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  38.16 
 
 
205 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  37.93 
 
 
210 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  38.83 
 
 
211 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  38.83 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  38.83 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  36.71 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  35.12 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  37.75 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  35.58 
 
 
205 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  36.23 
 
 
208 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  36.19 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  36.54 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  35.24 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  35.71 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  35.71 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  36.67 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  37.62 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  35.92 
 
 
208 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  35.61 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  34.76 
 
 
215 aa  128  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  34.29 
 
 
215 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  35.98 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  35.24 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  33 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  32.38 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  33.82 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  36.63 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  36.14 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  35.85 
 
 
210 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  124  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 
211 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  36.06 
 
 
206 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  32.69 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  34.15 
 
 
205 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  36.54 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  33.98 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  33.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  32.85 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  34.93 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  32.86 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  35.27 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  34.45 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  35.03 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  32.69 
 
 
214 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  34.3 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  30.95 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>