More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0020 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
142 aa  295  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  97.89 
 
 
142 aa  290  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  90.85 
 
 
142 aa  273  6e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  43.51 
 
 
151 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  41.41 
 
 
145 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  46.51 
 
 
136 aa  115  1e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  40.74 
 
 
137 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  39.13 
 
 
144 aa  107  8e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.37697e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  35.61 
 
 
139 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  40 
 
 
150 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  40.46 
 
 
154 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.54751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  37.12 
 
 
143 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  37.12 
 
 
138 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
135 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  44.19 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  35.46 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
153 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.99535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 
174 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 
166 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.2945e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  40.31 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  35.46 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  40.31 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.0057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  40.31 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  1.72777e-06 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  40.31 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  40.31 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  40.31 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  36.03 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  40.31 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.15951e-12 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.12773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  39.53 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.64453e-12  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  34.53 
 
 
151 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  34.53 
 
 
151 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  5.72819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  34.06 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.44204e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  8.32394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  34.53 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51163e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.17 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.38692e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  35.34 
 
 
135 aa  92  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.88 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  34.11 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  36.72 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  33.58 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  36.23 
 
 
154 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.39269e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  38.28 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  36.5 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.44475e-05 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  31.3 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1241  ferric uptake regulator, Fur family  33.83 
 
 
170 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00903138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.17 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  32.33 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  31.34 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  28.36 
 
 
167 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 
167 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 
167 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  31.82 
 
 
157 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  31.82 
 
 
157 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  31.82 
 
 
157 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 
142 aa  82.8  1e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 
150 aa  83.2  1e-15  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  33.82 
 
 
143 aa  82.8  1e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  31.58 
 
 
155 aa  83.2  1e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  1.54091e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 
141 aa  83.2  1e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 
139 aa  82.4  2e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 
159 aa  82.4  2e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.2 
 
 
145 aa  82  2e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.48432e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 
151 aa  81.6  3e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
149 aa  82  3e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
151 aa  80.9  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  29.01 
 
 
155 aa  80.9  5e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0396  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
175 aa  80.5  8e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  32.37 
 
 
151 aa  80.5  8e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  31.62 
 
 
152 aa  80.1  9e-15  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.93805e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
158 aa  80.1  9e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 
143 aa  79.7  1e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>