More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4572 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  100 
 
 		 373 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4550  integrase family protein  55.52 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.798479 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  52.73 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3696  integrase domain protein SAM domain protein  30.45 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.851802  normal  0.785312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0229  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0287  integrase domain protein SAM domain protein  31.18 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.48 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  31.8 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.16 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.99 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  29.18 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.7 
 
 		 313 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.36 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  28.81 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000863146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 293 aa  99.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.48 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.23 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.11 
 
 		 295 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.11 
 
 		 290 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 302 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.77 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  30.3 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 296 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  28.13 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 277 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  27.96 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.64 
 
 		 298 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.86 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.78 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  28.28 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.3 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2492  integrase family protein  26.2 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 302 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.85 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.17 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  28.44 
 
 		 313 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  30.48 
 
 		 310 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 		 296 aa  86.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.16 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  29.72 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.78 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  25.61 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.59 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.27 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  24.14 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  29.5 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2178  phage integrase family protein  26.71 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  24.62 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  27.27 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.52 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.25 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  23.91 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  25.28 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.77 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.75 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.46 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  25.57 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  27.9 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25.55 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.75 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  25.7 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.63 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  24.7 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  28.13 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.76 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.57 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  27.72 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.98 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.19 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2807  Phage integrase  27.24 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  28.41 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  26.99 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  26.47 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  25.41 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.61 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.72 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>