More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4533 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  98.72 
 
 
1172 aa  2403    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  58.13 
 
 
1145 aa  1197    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 
1172 aa  2432    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5881  DNA primase catalytic core domain protein  41.87 
 
 
1117 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211197 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  27.57 
 
 
1000 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  25.14 
 
 
775 aa  125  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.96 
 
 
775 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  29.66 
 
 
605 aa  112  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  29.12 
 
 
611 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  29.68 
 
 
777 aa  110  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  32.93 
 
 
777 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  32.93 
 
 
777 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  31.71 
 
 
777 aa  109  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  26.95 
 
 
595 aa  106  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  30.71 
 
 
777 aa  105  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  33.33 
 
 
777 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  26.63 
 
 
477 aa  102  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  26.45 
 
 
595 aa  101  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  27.23 
 
 
604 aa  101  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  30.71 
 
 
776 aa  101  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  28.57 
 
 
601 aa  99.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  26.09 
 
 
717 aa  99  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  25.92 
 
 
717 aa  98.2  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  28.68 
 
 
605 aa  97.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  28.61 
 
 
682 aa  97.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  26.17 
 
 
646 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  26.17 
 
 
646 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  27.38 
 
 
600 aa  96.3  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  29.06 
 
 
601 aa  95.9  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  28.34 
 
 
634 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.11 
 
 
531 aa  95.5  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  28.19 
 
 
684 aa  95.5  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  24.14 
 
 
636 aa  95.1  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  25.22 
 
 
717 aa  95.1  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  29.25 
 
 
636 aa  94  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  30.17 
 
 
593 aa  94  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0175  DNA primase  26.57 
 
 
600 aa  93.6  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  26.72 
 
 
578 aa  94  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  26.56 
 
 
686 aa  93.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  25.93 
 
 
588 aa  90.9  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  26.27 
 
 
595 aa  91.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  25.45 
 
 
675 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  26.49 
 
 
662 aa  89.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  26.78 
 
 
626 aa  89  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  26.17 
 
 
771 aa  88.2  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  25.69 
 
 
763 aa  88.2  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1734  P4 family phage/plasmid primase  30.73 
 
 
624 aa  87.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  26.3 
 
 
586 aa  87  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  27.46 
 
 
605 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  25.83 
 
 
675 aa  86.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  27.46 
 
 
605 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  31 
 
 
763 aa  86.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  24.26 
 
 
677 aa  86.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  24.07 
 
 
640 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  24.07 
 
 
694 aa  85.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  24.03 
 
 
677 aa  85.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  29.13 
 
 
507 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  24.26 
 
 
677 aa  84.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  26.09 
 
 
614 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  28.9 
 
 
599 aa  84.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  25.71 
 
 
656 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  27.35 
 
 
583 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  26.82 
 
 
703 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  25.13 
 
 
587 aa  83.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  26.16 
 
 
625 aa  83.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  26.73 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  21.91 
 
 
769 aa  82.8  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  24.62 
 
 
629 aa  82.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.05 
 
 
524 aa  82.4  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  24.35 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  29.41 
 
 
577 aa  82.4  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  29.59 
 
 
582 aa  82  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  25.12 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  25.71 
 
 
660 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  26.54 
 
 
600 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  26.69 
 
 
598 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  26.87 
 
 
640 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  26.37 
 
 
598 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  24.28 
 
 
463 aa  80.1  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  26.74 
 
 
634 aa  80.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  25.69 
 
 
666 aa  80.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  25.39 
 
 
452 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  26.65 
 
 
609 aa  80.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  25.44 
 
 
655 aa  80.5  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  26.75 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  25.28 
 
 
639 aa  80.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  25.97 
 
 
621 aa  79.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  23.39 
 
 
746 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  23.39 
 
 
746 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.3 
 
 
828 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1436  DNA primase  26.51 
 
 
681 aa  79  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  26.4 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  26.69 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  26.4 
 
 
598 aa  79  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  26.4 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  26.4 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  26.4 
 
 
598 aa  79  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  24.77 
 
 
604 aa  79  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  24.11 
 
 
616 aa  78.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  25.75 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>