More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4516 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  426  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  426  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  27.8 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  28.21 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.66 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
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NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.57 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  30.65 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  34.09 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  26.13 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  28.47 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  26.67 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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