22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4378 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  40.98 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0871  hypothetical protein  35.38 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302408  normal  0.0367902 
 
 
 
NC_012034  Athe_2006  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0639665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1351  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  34.43 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  34.43 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  37.7 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  47.5 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  34.43 
 
 
75 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  36.51 
 
 
139 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  32.76 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4651  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000711618 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  42.37 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  35.38 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  47.5 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>