48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4158 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1057    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  98.87 
 
 
533 aa  1047    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  51.89 
 
 
526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  38.37 
 
 
535 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  37.75 
 
 
532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  37.15 
 
 
528 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  38.04 
 
 
517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  37.35 
 
 
528 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  34.38 
 
 
546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  36.68 
 
 
547 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  32.97 
 
 
546 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  32.97 
 
 
546 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  30.04 
 
 
543 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  27.51 
 
 
569 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.93 
 
 
557 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  34.29 
 
 
592 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  34.29 
 
 
592 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  28.19 
 
 
605 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  30.97 
 
 
618 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  27.57 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  33.15 
 
 
516 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  33.15 
 
 
516 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  33.15 
 
 
516 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  33.15 
 
 
516 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  25.67 
 
 
558 aa  64.7  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  32.6 
 
 
516 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  39.36 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  23.27 
 
 
618 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  28 
 
 
557 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  27.96 
 
 
534 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  28 
 
 
557 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30 
 
 
531 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
513 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  29.21 
 
 
658 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  27.03 
 
 
531 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  25.53 
 
 
564 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  23.18 
 
 
563 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  31.15 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  29.71 
 
 
616 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.36 
 
 
607 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  31.28 
 
 
544 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.85 
 
 
729 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  22.62 
 
 
507 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  22.18 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  24.86 
 
 
588 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  38.96 
 
 
727 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  28.82 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>