More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3984 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  47.78 
 
 
659 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  63.88 
 
 
680 aa  874    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  99.56 
 
 
676 aa  1385    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  100 
 
 
676 aa  1390    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  54.36 
 
 
673 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  47.19 
 
 
658 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  49.93 
 
 
708 aa  693    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  49.05 
 
 
673 aa  652    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  52.74 
 
 
686 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  46.1 
 
 
661 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  46.75 
 
 
661 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  46.6 
 
 
661 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  47.12 
 
 
655 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  45.79 
 
 
725 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  45.97 
 
 
670 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  45.08 
 
 
728 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46 
 
 
676 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  45.8 
 
 
683 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  41.49 
 
 
806 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.02 
 
 
663 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  44.17 
 
 
709 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  41.21 
 
 
777 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  44.64 
 
 
659 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  42.53 
 
 
661 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  45.74 
 
 
677 aa  538  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  42.77 
 
 
675 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  54.43 
 
 
675 aa  531  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  52.73 
 
 
569 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  53.8 
 
 
580 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  42.54 
 
 
675 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  48.91 
 
 
611 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.03 
 
 
644 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  43.02 
 
 
710 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  39.62 
 
 
783 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  42.9 
 
 
636 aa  498  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  39.25 
 
 
787 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  39.49 
 
 
794 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  39.87 
 
 
793 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  39.67 
 
 
778 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  49.5 
 
 
607 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  49.79 
 
 
583 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  39.68 
 
 
829 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  41.23 
 
 
647 aa  465  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  40.23 
 
 
790 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.82 
 
 
586 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  38.52 
 
 
725 aa  445  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  46.52 
 
 
589 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  44.61 
 
 
592 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  46.68 
 
 
608 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  45.87 
 
 
793 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  45.51 
 
 
587 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.99 
 
 
691 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  45.85 
 
 
763 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  46.5 
 
 
552 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  39.92 
 
 
799 aa  355  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  45.92 
 
 
371 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 
316 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  32.42 
 
 
574 aa  191  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.53 
 
 
587 aa  190  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  31.47 
 
 
697 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  31.43 
 
 
574 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.32 
 
 
574 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30.06 
 
 
505 aa  173  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.93 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.14 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  29.51 
 
 
822 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  28.25 
 
 
527 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  52.35 
 
 
356 aa  160  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  29.46 
 
 
493 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  28.19 
 
 
495 aa  154  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  28.93 
 
 
513 aa  153  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.85 
 
 
808 aa  151  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 
496 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  32.08 
 
 
508 aa  148  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  32.08 
 
 
523 aa  148  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.45 
 
 
633 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  27.22 
 
 
523 aa  147  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 
511 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  27.26 
 
 
499 aa  146  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 
530 aa  145  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 
530 aa  145  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.35 
 
 
503 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 
544 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 
498 aa  144  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.79 
 
 
873 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 
501 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  26.68 
 
 
501 aa  142  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 
508 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  26.5 
 
 
540 aa  142  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  27.78 
 
 
520 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  27.78 
 
 
520 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.86 
 
 
516 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  28.54 
 
 
526 aa  140  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.93 
 
 
497 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.17 
 
 
508 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 
532 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  29.38 
 
 
501 aa  139  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 
498 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.57 
 
 
568 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 
510 aa  138  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>