More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3920 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  56.67 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  54.84 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  50.75 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  52.54 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  54.24 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  50 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  51.92 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 230 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.71 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  52.54 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  52.54 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0675  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00384462  hitchhiker  0.000593607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  42.37 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  41.79 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  39.34 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  40.62 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>