More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3826 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
329 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
329 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  70.95 
 
 
331 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  59.63 
 
 
327 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  57.8 
 
 
328 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
327 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  55.66 
 
 
327 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  53.8 
 
 
325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  47.24 
 
 
328 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 
329 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
333 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 
333 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  46.65 
 
 
329 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  44.82 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  45.43 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  44.58 
 
 
328 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  44.51 
 
 
328 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
475 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 
127 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 
128 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  35.9 
 
 
156 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
496 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
137 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 
159 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
146 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.33 
 
 
223 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.47 
 
 
480 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  39.47 
 
 
483 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
130 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.93 
 
 
503 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 
126 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
480 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0954  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.62 
 
 
495 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
255 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 
126 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
129 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  38.16 
 
 
480 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
480 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  32.89 
 
 
484 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
254 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.97 
 
 
503 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.03 
 
 
501 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
502 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.97 
 
 
502 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
502 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  30.83 
 
 
463 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.08 
 
 
501 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
513 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.12 
 
 
515 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
121 aa  56.2  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 
305 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
131 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
503 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  43.08 
 
 
502 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  29.13 
 
 
126 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
139 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
546 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  39.44 
 
 
520 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
467 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
564 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
562 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
501 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  36.71 
 
 
564 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
502 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
473 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
564 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
564 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36.71 
 
 
561 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 
125 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
506 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  38.96 
 
 
477 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  44.44 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.44 
 
 
504 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
506 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0780  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
494 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 
507 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
501 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 
120 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  42.65 
 
 
521 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
506 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>