More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3611 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  39.14 
 
 
1132 aa  776    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  82.21 
 
 
1183 aa  2059    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  47.09 
 
 
1154 aa  1083    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  39.25 
 
 
1169 aa  782    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  46.5 
 
 
1156 aa  1051    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  59.83 
 
 
1188 aa  1455    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.14 
 
 
1132 aa  781    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  45.64 
 
 
1181 aa  1012    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.31 
 
 
1132 aa  776    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.29 
 
 
1133 aa  780    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.31 
 
 
1133 aa  779    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  38.73 
 
 
1132 aa  768    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  48.02 
 
 
1154 aa  1084    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  37.89 
 
 
1189 aa  791    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  47.26 
 
 
1158 aa  1068    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  60.15 
 
 
1182 aa  1461    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  58.87 
 
 
1187 aa  1434    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  47.76 
 
 
1171 aa  1073    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  47.11 
 
 
1173 aa  1069    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  75.25 
 
 
1178 aa  1875    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  39.97 
 
 
1136 aa  790    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  75.67 
 
 
1176 aa  1911    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3349  methionine synthase  44.04 
 
 
1214 aa  955    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  40.64 
 
 
1149 aa  801    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  47.89 
 
 
1184 aa  1106    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  44.5 
 
 
1171 aa  1002    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  45.13 
 
 
1193 aa  1006    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  63.55 
 
 
1208 aa  1581    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  64.6 
 
 
1208 aa  1631    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.31 
 
 
1132 aa  776    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  41.76 
 
 
1163 aa  887    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  60.18 
 
 
1188 aa  1464    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  69.7 
 
 
1190 aa  1741    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  98.66 
 
 
1191 aa  2441    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  46.24 
 
 
1182 aa  1029    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  47.54 
 
 
1178 aa  1087    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  40.6 
 
 
1150 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  47.94 
 
 
1169 aa  1082    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  47.24 
 
 
1199 aa  1061    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  60.52 
 
 
1188 aa  1456    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  40.15 
 
 
1150 aa  824    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  47.3 
 
 
1151 aa  1018    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  45.37 
 
 
1223 aa  1048    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  33 
 
 
1266 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16010  methionine synthase (B12-dependent)  45.34 
 
 
1176 aa  1026    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471767  normal  0.0779461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  60.33 
 
 
1182 aa  1467    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  39.29 
 
 
1132 aa  781    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  38.88 
 
 
1196 aa  817    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  38.16 
 
 
1208 aa  809    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  46.33 
 
 
1157 aa  1058    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  48.16 
 
 
1167 aa  1067    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  40.15 
 
 
1150 aa  821    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  76.96 
 
 
1197 aa  1941    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  68.22 
 
 
1224 aa  1722    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  47.16 
 
 
1195 aa  1040    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  41.7 
 
 
1156 aa  879    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0064  methionine synthase  38.41 
 
 
1254 aa  809    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.496444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.31 
 
 
1132 aa  778    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.32 
 
 
1132 aa  779    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  38.15 
 
 
1180 aa  816    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3627  methionine synthase (B12-dependent)  44 
 
 
1216 aa  952    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  70.99 
 
 
1212 aa  1814    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  46.73 
 
 
1158 aa  1038    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  41.7 
 
 
1136 aa  819    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  44.51 
 
 
1168 aa  1011    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  45.43 
 
 
1215 aa  1021    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  100 
 
 
1191 aa  2469    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  62.53 
 
 
1214 aa  1547    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  39.39 
 
 
1132 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  59.65 
 
 
1191 aa  1447    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  47.39 
 
 
1192 aa  1093    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  32.82 
 
 
1261 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  32.09 
 
 
1274 aa  615  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  33.03 
 
 
1245 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  33.5 
 
 
1264 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  32.82 
 
 
1243 aa  612  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  33.8 
 
 
1264 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3149  B12-dependent methionine synthase  33.52 
 
 
1220 aa  609  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  32.2 
 
 
1250 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  33.47 
 
 
1251 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  32.36 
 
 
1236 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  33.03 
 
 
1251 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  32.68 
 
 
1257 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  32.18 
 
 
1257 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  32.65 
 
 
1252 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  31.92 
 
 
1247 aa  592  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  31.47 
 
 
1238 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  32.31 
 
 
1261 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  32.49 
 
 
1250 aa  588  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  31.89 
 
 
1263 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  32.15 
 
 
1224 aa  586  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  32.54 
 
 
1239 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  31.91 
 
 
1209 aa  588  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  31.53 
 
 
1227 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  32.31 
 
 
1261 aa  588  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  32.19 
 
 
1227 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  32.15 
 
 
1257 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  31.11 
 
 
1244 aa  587  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  32.24 
 
 
1227 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  32.87 
 
 
1228 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>