More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3593 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  99.74 
 
 
454 aa  759  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  100 
 
 
384 aa  758  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  43.24 
 
 
446 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  34.8 
 
 
456 aa  192  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  36 
 
 
508 aa  130  5e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  39.02 
 
 
175 aa  81.3  3e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  36.08 
 
 
185 aa  78.6  2e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  34.38 
 
 
781 aa  77.8  3e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
189 aa  77.8  3e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  35.09 
 
 
495 aa  76.6  7e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  25.35 
 
 
358 aa  75.5  1e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.92 
 
 
185 aa  75.5  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  29.81 
 
 
191 aa  75.9  1e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  32.92 
 
 
185 aa  75.1  2e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  32.73 
 
 
947 aa  74.7  2e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  32.12 
 
 
281 aa  75.1  2e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
191 aa  74.3  3e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  30.49 
 
 
830 aa  74.3  3e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  28.03 
 
 
473 aa  73.2  7e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  30 
 
 
948 aa  73.2  7e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  32.32 
 
 
196 aa  72  1e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
828 aa  72.4  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32.32 
 
 
195 aa  72.4  1e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  29.88 
 
 
268 aa  72  2e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  30.46 
 
 
324 aa  71.6  2e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  30.82 
 
 
187 aa  71.2  3e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  29.44 
 
 
492 aa  70.9  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.63 
 
 
828 aa  70.5  4e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.47 
 
 
869 aa  70.9  4e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  32.3 
 
 
196 aa  70.9  4e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
834 aa  70.5  5e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
191 aa  70.1  7e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  24.29 
 
 
833 aa  70.1  7e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  32.35 
 
 
495 aa  69.7  8e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  29.56 
 
 
779 aa  69.7  9e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  29.27 
 
 
551 aa  69.3  9e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  32.35 
 
 
495 aa  69.3  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  27.78 
 
 
264 aa  68.9  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  31.54 
 
 
212 aa  68.2  2e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
478 aa  67.8  3e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.12 
 
 
920 aa  68.2  3e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.96 
 
 
178 aa  67.8  3e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  28.02 
 
 
422 aa  67.8  3e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.78 
 
 
869 aa  67.4  4e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.25 
 
 
827 aa  67.4  4e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  33.13 
 
 
558 aa  66.6  7e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.32683e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  33.13 
 
 
558 aa  66.6  7e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  31.29 
 
 
178 aa  66.2  9e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.54 
 
 
852 aa  65.5  2e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  32.52 
 
 
940 aa  64.7  2e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  32.52 
 
 
558 aa  64.7  2e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  31.61 
 
 
365 aa  64.7  3e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.53 
 
 
823 aa  64.7  3e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.34 
 
 
352 aa  64.3  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  25.15 
 
 
387 aa  64.3  4e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  30.95 
 
 
192 aa  63.9  4e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  24.67 
 
 
270 aa  64.3  4e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  30.9 
 
 
603 aa  63.9  4e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  25 
 
 
869 aa  63.9  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.2 
 
 
377 aa  63.9  5e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.16 
 
 
912 aa  63.5  5e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.59 
 
 
378 aa  63.5  6e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.97973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
824 aa  63.5  6e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  27.75 
 
 
439 aa  63.2  7e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  29.27 
 
 
184 aa  63.2  7e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  32.33 
 
 
238 aa  63.2  7e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  24.82 
 
 
936 aa  63.2  8e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.1 
 
 
177 aa  63.2  9e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  30.63 
 
 
216 aa  62.8  9e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.78 
 
 
931 aa  62.8  9e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  26.04 
 
 
277 aa  62.8  1e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.39 
 
 
446 aa  62.4  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  25.62 
 
 
922 aa  62.4  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  28.4 
 
 
915 aa  62.4  1e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  26.26 
 
 
417 aa  62.8  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 
400 aa  62.4  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.67 
 
 
191 aa  61.6  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 
921 aa  61.6  2e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.39 
 
 
422 aa  61.6  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  29.28 
 
 
196 aa  61.6  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  23.75 
 
 
910 aa  60.8  3e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
385 aa  61.2  3e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.88 
 
 
919 aa  60.8  3e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25.29 
 
 
812 aa  60.8  3e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
192 aa  60.5  4e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
391 aa  60.8  4e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.4 
 
 
264 aa  60.8  4e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
192 aa  60.5  5e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
192 aa  60.5  5e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  30.25 
 
 
219 aa  60.5  5e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25 
 
 
919 aa  60.1  6e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
379 aa  60.1  7e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  27.33 
 
 
270 aa  60.1  7e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  30.16 
 
 
374 aa  60.1  7e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  31.1 
 
 
234 aa  60.1  7e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  28.75 
 
 
952 aa  59.7  8e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.63 
 
 
351 aa  59.7  8e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.63 
 
 
348 aa  59.7  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.56 
 
 
379 aa  59.7  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.63 
 
 
348 aa  59.7  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>