More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3546 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  100 
 
 		 181 aa  361  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  99.45 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  81.11 
 
 		 182 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  71.67 
 
 		 182 aa  278  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  72.22 
 
 		 187 aa  271  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  71.67 
 
 		 182 aa  268  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  70.56 
 
 		 182 aa  265  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  69.44 
 
 		 182 aa  260  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  65.73 
 
 		 182 aa  244  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  63.48 
 
 		 182 aa  244  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  68.79 
 
 		 173 aa  243  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  66.29 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  63.48 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  65.73 
 
 		 182 aa  240  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  66.29 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  65.73 
 
 		 182 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  65.73 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  67.05 
 
 		 173 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  57.14 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  57.23 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  54.7 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  57.39 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  55.25 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 184 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  55.8 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 186 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  53.59 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  56 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  56 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  56 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.84 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  52.6 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 192 aa  190  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  51.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0629  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.701086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  58.33 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  51.38 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.41 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  54.55 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  50 
 
 		 187 aa  183  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  48.89 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0259  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1508  ribosome recycling factor  50.88 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0285  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  50.57 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  50.86 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0232  ribosome recycling factor  48.84 
 
 		 185 aa  180  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  51.15 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  50.83 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.85 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  51.7 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>