More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3382 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3382  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0270482  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2721  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2618  F0F1 ATP synthase subunit gamma  79.3 
 
 
314 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2610  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.89 
 
 
315 aa  485  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0555449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  75.16 
 
 
315 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1493  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.25 
 
 
315 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0141448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  73.89 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2198  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.06 
 
 
314 aa  458  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.535458  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  61.59 
 
 
316 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0489  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.6 
 
 
317 aa  360  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04841  F0F1 ATP synthase subunit gamma  60.83 
 
 
316 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15691  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.49 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0980  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.54 
 
 
316 aa  355  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18481  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.54 
 
 
316 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.672263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  59.55 
 
 
316 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24766  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  55.31 
 
 
365 aa  352  5e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.057416  normal  0.404649 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16521  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.6 
 
 
316 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.6 
 
 
316 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.198196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16291  F0F1 ATP synthase subunit gamma  58.6 
 
 
316 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  56.45 
 
 
369 aa  347  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.12 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.49 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.45 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.85 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.45 
 
 
287 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.49 
 
 
282 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
287 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.73 
 
 
286 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.13 
 
 
281 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.41 
 
 
286 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.58 
 
 
287 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.43 
 
 
288 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
286 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.61 
 
 
286 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  41.27 
 
 
287 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  38.06 
 
 
287 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.94 
 
 
288 aa  205  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
286 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
286 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.92 
 
 
286 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.29 
 
 
286 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.97 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.37 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1026  ATP synthase F1, gamma subunit  36.19 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.720203  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  37.1 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.78 
 
 
287 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 
286 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 
286 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.9 
 
 
283 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  38.54 
 
 
289 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.51 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.34 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.13 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.94 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.26 
 
 
291 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.01 
 
 
295 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.69 
 
 
291 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4203  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
287 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00940728  normal  0.140573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
287 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0221655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
287 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37642  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  39.81 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.14 
 
 
289 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  35.85 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
293 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.31 
 
 
291 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  37.34 
 
 
288 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.66 
 
 
288 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4091  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
287 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0007  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.83 
 
 
287 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.180546  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4076  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
287 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4463  ATP synthase F1, gamma subunit  36.45 
 
 
286 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  hitchhiker  0.0000000162281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4197  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
287 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
295 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
287 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.35 
 
 
289 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 
287 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326291  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.14 
 
 
298 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.99 
 
 
286 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 
285 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4619  ATP synthase F1, gamma subunit  39.23 
 
 
299 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.51 
 
 
287 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
290 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
290 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  35.87 
 
 
291 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  34.87 
 
 
345 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.78 
 
 
288 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.45 
 
 
288 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  37.03 
 
 
286 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>