172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3347 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  328  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 
160 aa  328  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  69.43 
 
 
169 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  61.54 
 
 
172 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  60.53 
 
 
175 aa  209  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  53.33 
 
 
175 aa  158  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  42.95 
 
 
171 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  42.95 
 
 
171 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  44.03 
 
 
197 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  44.03 
 
 
197 aa  119  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  40.52 
 
 
190 aa  113  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.52 
 
 
190 aa  113  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  40.28 
 
 
197 aa  111  4e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  39.87 
 
 
184 aa  107  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  41.18 
 
 
174 aa  107  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.82 
 
 
186 aa  107  8e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  33.85 
 
 
1202 aa  68.9  3e-11  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  27.08 
 
 
158 aa  64.7  5e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  25.62 
 
 
168 aa  63.2  1e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  59.7  1e-08  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.48 
 
 
446 aa  56.6  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  31.68 
 
 
560 aa  56.6  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  31.2 
 
 
1361 aa  56.2  2e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  31.52 
 
 
439 aa  54.7  6e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  32.14 
 
 
572 aa  53.9  9e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  9.00599e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  32.38 
 
 
428 aa  53.9  1e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  29.32 
 
 
461 aa  53.1  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.31 
 
 
428 aa  51.2  6e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  31.09 
 
 
469 aa  50.8  7e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  2.01302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.46 
 
 
713 aa  50.8  7e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  32.5 
 
 
960 aa  50.8  7e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.69 
 
 
436 aa  50.4  9e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  30.51 
 
 
658 aa  50.1  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.57 
 
 
427 aa  50.1  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.08 
 
 
450 aa  50.4  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  32.08 
 
 
432 aa  50.1  1e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.36659e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  30.17 
 
 
560 aa  49.7  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.57 
 
 
407 aa  49.7  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.84 
 
 
581 aa  49.7  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.17 
 
 
567 aa  49.3  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  1.19274e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  33.33 
 
 
453 aa  48.9  3e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.69 
 
 
403 aa  48.9  3e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  35.14 
 
 
620 aa  48.1  4e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.63 
 
 
1028 aa  48.1  5e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0790  hypothetical protein  44.83 
 
 
343 aa  48.1  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  27.82 
 
 
444 aa  47.8  6e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  27.82 
 
 
444 aa  47.8  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.46 
 
 
440 aa  47.8  7e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  27.82 
 
 
444 aa  47.8  7e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  31.97 
 
 
1042 aa  47.4  8e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  40 
 
 
1059 aa  47.4  9e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.12 
 
 
407 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.6 
 
 
446 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  26.22 
 
 
444 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1809  hypothetical protein  31.07 
 
 
389 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 
1279 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.74 
 
 
445 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  32.23 
 
 
403 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  29.29 
 
 
669 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  29.41 
 
 
426 aa  46.6  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  24.14 
 
 
996 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  1.0419e-05  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  27.69 
 
 
451 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  31.36 
 
 
728 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.11 
 
 
436 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.89 
 
 
1021 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  25.32 
 
 
443 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.63 
 
 
769 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.98 
 
 
449 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.69 
 
 
430 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.86 
 
 
590 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  31.43 
 
 
442 aa  44.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  31.93 
 
 
428 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  28.93 
 
 
675 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.67 
 
 
441 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.39 
 
 
450 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  30.43 
 
 
439 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  25.32 
 
 
443 aa  44.3  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  27.69 
 
 
461 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  25.32 
 
 
443 aa  44.3  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  28.16 
 
 
431 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  30.53 
 
 
1167 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.06 
 
 
362 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.3 
 
 
615 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  35.85 
 
 
789 aa  44.3  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.15 
 
 
442 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.2 
 
 
450 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.57 
 
 
442 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  24.41 
 
 
450 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  24.41 
 
 
462 aa  43.9  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.9 
 
 
432 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  29.41 
 
 
430 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.41 
 
 
432 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  27.45 
 
 
1078 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3857  WD40 domain protein beta Propeller  31.09 
 
 
290 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4943  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.18 
 
 
431 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  28.16 
 
 
431 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  30.4 
 
 
438 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.71 
 
 
633 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.18 
 
 
431 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  28.16 
 
 
431 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>