226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3306 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  59.57 
 
 		 561 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  56.31 
 
 		 565 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  99.82 
 
 		 568 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 568 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  26.86 
 
 		 683 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  26.61 
 
 		 749 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  23.06 
 
 		 676 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  23.06 
 
 		 676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  28.16 
 
 		 553 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  26.42 
 
 		 639 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  21.58 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  26.22 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 		 668 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  42.15 
 
 		 606 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  40.87 
 
 		 605 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  39.2 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.23 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.64 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.64 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.09 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.17 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  22.87 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.6 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.37 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 345 aa  67  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.34 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.99 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.96 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.84 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.78 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.08 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.11 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.89 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.89 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.09 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.92 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.49 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.89 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  23.91 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.64 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.07 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.09 
 
 		 346 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  31.75 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.01 
 
 		 350 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  23.33 
 
 		 335 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 332 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.53 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.36 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.98 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 347 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  33.08 
 
 		 666 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 		 356 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.51 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  22.42 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.05 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.51 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.51 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.51 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  25.33 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.76 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.76 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  26.4 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  23.62 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  23.83 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  25.41 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.06 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  23.86 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23.96 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.15 
 
 		 368 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 		 333 aa  57  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  24.39 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  23.7 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  35.58 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.39 
 
 		 346 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  24.39 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  24.39 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 564 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  24.39 
 
 		 417 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  24.39 
 
 		 417 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  24.39 
 
 		 402 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  24.53 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>