More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3296 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
229 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
229 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  57.85 
 
 
227 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  55.31 
 
 
227 aa  262  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.45 
 
 
227 aa  245  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  48 
 
 
227 aa  234  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  44.09 
 
 
237 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.05 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
234 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
235 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
235 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  30.22 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.67 
 
 
225 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.19 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.56 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.09 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  24.62 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.86 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.75 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.72 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  23.27 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.62 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.88 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.37 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.5 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.5 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.77 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  22.44 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  23.88 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  22.28 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.56 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 
419 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.5 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  23.5 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.98 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.6 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  22.56 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  21.97 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  21.84 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  25.13 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.1 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 
157 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.13 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.12 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5645  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.81 
 
 
240 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  26.18 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
230 aa  62  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.62 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  23.67 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.35 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.87 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.12 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  23.71 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.32 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.62 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  26.09 
 
 
210 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 
1056 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>