More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3286 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  59.65 
 
 
607 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  59.65 
 
 
607 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  57.7 
 
 
627 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  57.7 
 
 
627 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  56.37 
 
 
648 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  54.06 
 
 
661 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 
596 aa  1236    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  59.65 
 
 
607 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  55.59 
 
 
635 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  54.84 
 
 
634 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  55.92 
 
 
635 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  59.65 
 
 
607 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  56.37 
 
 
648 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  56.18 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  49.09 
 
 
589 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  54.47 
 
 
502 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  38.79 
 
 
666 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 
549 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  40.14 
 
 
568 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.15 
 
 
602 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  41.41 
 
 
449 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  37.52 
 
 
566 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  39.18 
 
 
561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  41.26 
 
 
495 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  37.77 
 
 
568 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  38.1 
 
 
560 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  38.1 
 
 
560 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  38.61 
 
 
553 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  40.46 
 
 
556 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  50.75 
 
 
338 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  50.75 
 
 
338 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  38.93 
 
 
569 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 
495 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 
585 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  39.11 
 
 
585 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.1 
 
 
548 aa  343  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.1 
 
 
548 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.1 
 
 
548 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.1 
 
 
548 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.1 
 
 
548 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.1 
 
 
548 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  37.61 
 
 
565 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  38.9 
 
 
585 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  42.49 
 
 
492 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  38.48 
 
 
576 aa  336  7e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  38.29 
 
 
576 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  38.48 
 
 
592 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  38.11 
 
 
576 aa  333  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  38.49 
 
 
503 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  36.92 
 
 
571 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06752  RNA-directed DNA polymerase  40.5 
 
 
490 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06869  RNA-directed DNA polymerase  40.5 
 
 
490 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02987  RNA-directed DNA polymerase  40.5 
 
 
490 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06166  RNA-directed DNA polymerase  40.5 
 
 
490 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  38.97 
 
 
490 aa  328  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2705  RNA-directed DNA polymerase  39.83 
 
 
503 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0443471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  35.58 
 
 
515 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  38.14 
 
 
544 aa  325  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0650  RNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 
495 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.629453  normal  0.520006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1820  RNA-directed DNA polymerase  39.47 
 
 
495 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000551323  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  40.33 
 
 
504 aa  325  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  40.33 
 
 
504 aa  324  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  40.33 
 
 
504 aa  325  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  40.12 
 
 
489 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  40.12 
 
 
489 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  40.12 
 
 
489 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  40.12 
 
 
489 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_002978  WD0693  reverse transcriptase, putative  37.5 
 
 
515 aa  321  3e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.435415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0995  reverse transcriptase  37.5 
 
 
515 aa  321  3e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1138  reverse transcriptase, putative  37.5 
 
 
515 aa  321  3e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 
490 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 
490 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 
490 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 
490 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 
490 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  39.92 
 
 
490 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  39.29 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  39.71 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2118  RNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 
490 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  38.9 
 
 
490 aa  307  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  38.69 
 
 
490 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  38.69 
 
 
490 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  38.69 
 
 
490 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 
458 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 
487 aa  299  8e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1120  RNA-directed DNA polymerase  66.81 
 
 
263 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.803825  hitchhiker  0.00935106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2439  RNA-directed DNA polymerase  66.81 
 
 
263 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24600  RNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 
505 aa  292  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.51 
 
 
437 aa  292  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2026  RNA-directed DNA polymerase  61.02 
 
 
264 aa  286  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0470  RNA-directed DNA polymerase  64.6 
 
 
262 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  31.76 
 
 
483 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  34.12 
 
 
439 aa  206  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  28.91 
 
 
587 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  31.44 
 
 
488 aa  193  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  33.89 
 
 
454 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>