More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3228 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  58.83 
 
 
543 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  100 
 
 
545 aa  1127    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  99.08 
 
 
545 aa  1118    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  56.74 
 
 
528 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  51.12 
 
 
545 aa  568  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50.83 
 
 
585 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  47.32 
 
 
479 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  43.37 
 
 
467 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  45.71 
 
 
472 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  34.36 
 
 
487 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  46.69 
 
 
260 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  33.07 
 
 
481 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  28.42 
 
 
404 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.57 
 
 
386 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.5 
 
 
363 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  24.94 
 
 
392 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  25.92 
 
 
376 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  25.6 
 
 
393 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.21 
 
 
196 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02891  hypothetical protein  48.53 
 
 
75 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.294183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.61 
 
 
187 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.89 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  27.14 
 
 
294 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  26.89 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.4 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  29.03 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  53.12 
 
 
171 aa  67.8  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.79 
 
 
560 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  20.83 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  57.63 
 
 
116 aa  67.4  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  20.83 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.54 
 
 
93 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  52.38 
 
 
90 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  59.02 
 
 
190 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  23.7 
 
 
575 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12460  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  50.82 
 
 
285 aa  64.7  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.214678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  25.76 
 
 
300 aa  64.3  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  25.77 
 
 
597 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  47.83 
 
 
194 aa  63.9  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  55 
 
 
100 aa  63.9  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  25.17 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  25.17 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  25.17 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2448  phospholipase D/transphosphatidylase  23.53 
 
 
558 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  25.17 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  25.95 
 
 
593 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  51.67 
 
 
279 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.86 
 
 
225 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.27 
 
 
226 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  25.17 
 
 
601 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  25.17 
 
 
601 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0447  phospholipase D family protein  26.64 
 
 
358 aa  62.4  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  50 
 
 
224 aa  62.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  26.78 
 
 
593 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.45 
 
 
222 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  24.66 
 
 
230 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  47.46 
 
 
79 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50.91 
 
 
277 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  24.66 
 
 
230 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  47.46 
 
 
79 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  47.46 
 
 
79 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.19 
 
 
227 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  26.32 
 
 
234 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50.82 
 
 
206 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
181 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2230  Soluble ligand binding domain protein  40.32 
 
 
180 aa  60.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0322679  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  25.34 
 
 
613 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  37.11 
 
 
254 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  52.54 
 
 
111 aa  60.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
181 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 
598 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 
598 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  47.62 
 
 
201 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1589  DNA uptake protein related DNA-binding protein  44.44 
 
 
211 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.821877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.76 
 
 
214 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  46.77 
 
 
213 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.79 
 
 
228 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  25.68 
 
 
598 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0313  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  45.71 
 
 
205 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0283813  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.93 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1429  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.18 
 
 
220 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0894635  hitchhiker  0.000989669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  42.86 
 
 
234 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  26.18 
 
 
177 aa  59.3  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.5 
 
 
590 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.86 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  23.08 
 
 
439 aa  58.5  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  39.47 
 
 
243 aa  58.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  24.75 
 
 
234 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  25.08 
 
 
591 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.24 
 
 
250 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  43.06 
 
 
254 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  23.26 
 
 
286 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  24.49 
 
 
561 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.66 
 
 
536 aa  57.4  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.12 
 
 
296 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.17 
 
 
600 aa  57  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07770  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  51.67 
 
 
255 aa  57  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.734048 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1428  hypothetical protein  50 
 
 
173 aa  57  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.53 
 
 
250 aa  57  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>