56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3226 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  100 
 
 
493 aa  1022    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1022    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  61.59 
 
 
487 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  48.28 
 
 
494 aa  465  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  47.89 
 
 
486 aa  465  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  45.47 
 
 
512 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  47.47 
 
 
512 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  39.52 
 
 
480 aa  354  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  30.41 
 
 
502 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0229  hypothetical protein  30.93 
 
 
491 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  30.18 
 
 
535 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  31.09 
 
 
446 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  25.92 
 
 
490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  28.91 
 
 
472 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03001  RecB family nuclease  27.65 
 
 
472 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  25 
 
 
483 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03571  RecB family nuclease  24.81 
 
 
483 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.551533  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  27.79 
 
 
472 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  28.73 
 
 
1118 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  30.77 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  24.13 
 
 
495 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.29 
 
 
1126 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  26.69 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.77 
 
 
1082 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.35 
 
 
1116 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  26.33 
 
 
1198 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  24.6 
 
 
1153 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  26.16 
 
 
394 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  26.16 
 
 
394 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.45 
 
 
1172 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3875  RecB family-like nuclease  21.69 
 
 
499 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00135732  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25 
 
 
1280 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.77 
 
 
1151 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.8 
 
 
1163 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1093  RecB family-like nuclease  23.97 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.3 
 
 
1215 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  28.09 
 
 
1139 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  24.41 
 
 
1121 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.13 
 
 
1196 aa  71.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  21.52 
 
 
1247 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24 
 
 
1350 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  25.88 
 
 
1250 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  27.59 
 
 
1143 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  26.44 
 
 
1228 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  27.59 
 
 
1143 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0167  RecB family-like nuclease  23.91 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  27.59 
 
 
1143 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  27.36 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  24.77 
 
 
1270 aa  67  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  24.03 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  23.53 
 
 
576 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  24.75 
 
 
479 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  25.48 
 
 
544 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  23.99 
 
 
545 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.18 
 
 
1324 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.99 
 
 
1255 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>