35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3064 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  69.02 
 
 
553 aa  820    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  62.16 
 
 
561 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  98.92 
 
 
568 aa  1147    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
558 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.82 
 
 
563 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.6 
 
 
557 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.01 
 
 
559 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.43 
 
 
557 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.41 
 
 
563 aa  360  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.37 
 
 
619 aa  263  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.73 
 
 
573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.74 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.53 
 
 
824 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.38 
 
 
821 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  30 
 
 
403 aa  63.9  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.4 
 
 
889 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.35 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.01 
 
 
446 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.05 
 
 
628 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.69 
 
 
428 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.89 
 
 
626 aa  54.3  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  28.35 
 
 
606 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.95 
 
 
432 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.63 
 
 
378 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.21 
 
 
773 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.76 
 
 
1034 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.09 
 
 
375 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.21 
 
 
845 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  26.88 
 
 
423 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  25.23 
 
 
586 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.76 
 
 
1034 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.35 
 
 
375 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.06 
 
 
440 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.11 
 
 
632 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.07 
 
 
262 aa  43.5  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>