29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2914 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  100 
 
 
88 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  100 
 
 
88 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  67.09 
 
 
84 aa  100  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  62.03 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  63.16 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  62.03 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  55.29 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  55.81 
 
 
86 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  53.49 
 
 
86 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.24 
 
 
86 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.24 
 
 
86 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  50.59 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  50.59 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  47.06 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  45.88 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  48.24 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  53.85 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  57.89 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  46.74 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  63.64 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.56 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.56 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.56 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  52.11 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  36.26 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  36.26 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  36.56 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  38.2 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>