More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2856 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
549 aa  1101    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
549 aa  1101    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  60.08 
 
 
550 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  31.33 
 
 
508 aa  246  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  29.53 
 
 
515 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  30.39 
 
 
504 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 
509 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 
509 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.68 
 
 
468 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  25 
 
 
627 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.66 
 
 
465 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.66 
 
 
465 aa  147  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.57 
 
 
469 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.47 
 
 
480 aa  143  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.96 
 
 
473 aa  143  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  28.09 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.66 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  25.37 
 
 
457 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.21 
 
 
441 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  26.56 
 
 
498 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25 
 
 
511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.48 
 
 
466 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  26.74 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  23.16 
 
 
488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.95 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.37 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.83 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.76 
 
 
481 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.2 
 
 
447 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.87 
 
 
491 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.46 
 
 
451 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.69 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.62 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.27 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.8 
 
 
514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  23.59 
 
 
434 aa  120  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.7 
 
 
479 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.52 
 
 
468 aa  117  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.46 
 
 
447 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  24.95 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.95 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.58 
 
 
477 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.94 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.36 
 
 
421 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.84 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.62 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  25.25 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  24.31 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.62 
 
 
474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.94 
 
 
439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.53 
 
 
468 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.39 
 
 
410 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.14 
 
 
440 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.07 
 
 
442 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.31 
 
 
472 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  25.52 
 
 
457 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  25.31 
 
 
457 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.06 
 
 
443 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  26.48 
 
 
460 aa  107  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.68 
 
 
674 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.45 
 
 
433 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 
589 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.22 
 
 
451 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  23.65 
 
 
441 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22 
 
 
460 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.83 
 
 
442 aa  105  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  24.4 
 
 
491 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.93 
 
 
468 aa  104  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.06 
 
 
458 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.91 
 
 
458 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.34 
 
 
453 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.11 
 
 
458 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.07 
 
 
480 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.7 
 
 
458 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.27 
 
 
444 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  27.09 
 
 
475 aa  101  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.61 
 
 
453 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.91 
 
 
438 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  27.07 
 
 
467 aa  100  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.03 
 
 
460 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.03 
 
 
460 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  23.04 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.39 
 
 
444 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 
576 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  22.97 
 
 
576 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.11 
 
 
453 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.48 
 
 
480 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  21.74 
 
 
463 aa  97.8  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  35.44 
 
 
227 aa  98.2  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.89 
 
 
466 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.6 
 
 
460 aa  97.8  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.94 
 
 
396 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.17 
 
 
471 aa  97.1  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  22.52 
 
 
463 aa  97.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  25.94 
 
 
396 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.94 
 
 
396 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  34.81 
 
 
179 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.94 
 
 
396 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 
330 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.62 
 
 
471 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>