More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2737 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  71.4 
 
 		 504 aa  725    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  71 
 
 		 499 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  98.8 
 
 		 499 aa  1015    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  71.92 
 
 		 505 aa  735    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  66.06 
 
 		 523 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  100 
 
 		 499 aa  1025    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  76.14 
 
 		 510 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  70.68 
 
 		 517 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  48.89 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  48.99 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  50.21 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  50.31 
 
 		 500 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  49.29 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  44.18 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  45.97 
 
 		 501 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  45.25 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  46.28 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  46.57 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  36.02 
 
 		 494 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  34.96 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  26.19 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  32.49 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  31.43 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  30.52 
 
 		 938 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  27.98 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  27.59 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  29.24 
 
 		 503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 503 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  30.36 
 
 		 508 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  29.26 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  29.65 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  29.65 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  27.66 
 
 		 506 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  27.22 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  27.82 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.29 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  28.27 
 
 		 522 aa  154  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  33.81 
 
 		 492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  27.68 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  26.48 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.05 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  28.46 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.04 
 
 		 505 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  26.37 
 
 		 514 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.79 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  26.16 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.59 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  25.05 
 
 		 514 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.95 
 
 		 740 aa  127  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  26.13 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.71 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  26.13 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 515 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  25.74 
 
 		 509 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  27.01 
 
 		 512 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.7 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  26 
 
 		 502 aa  101  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  25.93 
 
 		 595 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  24.85 
 
 		 554 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  23.53 
 
 		 645 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 506 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  23.63 
 
 		 494 aa  93.2  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  21.99 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  26.22 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.68 
 
 		 501 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  23.91 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.9 
 
 		 511 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.9 
 
 		 511 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.09 
 
 		 499 aa  87.4  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  23.83 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  23.74 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.86 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  23.33 
 
 		 512 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  26.65 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.95 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  22.94 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.34 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  26.57 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  25.19 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  23.14 
 
 		 512 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  24.52 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  23.36 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  20.22 
 
 		 505 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  22.13 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  25.09 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  22.05 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>