86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2716 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 1123 aa  2336    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 480 aa  97.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 480 aa  92  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  22.55 
 
 		 412 aa  77  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  24.28 
 
 		 471 aa  74.3  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 433 aa  72  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  23.73 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 383 aa  70.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  22.72 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  24.14 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  22.53 
 
 		 391 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  21.68 
 
 		 446 aa  64.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  21.86 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3694  hypothetical protein  26.43 
 
 		 777 aa  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.560249  normal  0.910445 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3230  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  24.63 
 
 		 731 aa  63.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  21.34 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  21.76 
 
 		 382 aa  60.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 		 422 aa  61.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  22.48 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  24.91 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.73 
 
 		 509 aa  57.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 430 aa  57.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  22.52 
 
 		 687 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 472 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 423 aa  57.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  22.64 
 
 		 455 aa  56.6  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2955  hypothetical protein  23.46 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000296771  unclonable  0.00000929698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  22.61 
 
 		 478 aa  57.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  22.81 
 
 		 619 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25 
 
 		 448 aa  56.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  22.33 
 
 		 634 aa  55.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  30.58 
 
 		 483 aa  55.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  21.87 
 
 		 386 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 494 aa  55.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 389 aa  54.7  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1332  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  21.77 
 
 		 751 aa  54.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000000692737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 		 456 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 561 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  23.79 
 
 		 478 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  22.56 
 
 		 508 aa  52.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  21.9 
 
 		 479 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  22.89 
 
 		 663 aa  51.6  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 519 aa  51.6  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.11 
 
 		 478 aa  51.6  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2483  piwi domain-containing protein  22.51 
 
 		 771 aa  51.6  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  22.65 
 
 		 403 aa  51.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 522 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  22.65 
 
 		 403 aa  51.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  24.5 
 
 		 526 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  23.3 
 
 		 467 aa  50.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 433 aa  50.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 502 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3970  stem cell self-renewal protein Piwi domain protein  22.65 
 
 		 764 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 334 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 462 aa  50.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1063 aa  50.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 394 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 463 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  22.99 
 
 		 622 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 611 aa  48.9  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 		 385 aa  48.5  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  23.58 
 
 		 423 aa  48.5  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 		 448 aa  48.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 481 aa  48.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  24.58 
 
 		 525 aa  47.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  23.71 
 
 		 474 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 477 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.78 
 
 		 456 aa  47.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  23.11 
 
 		 473 aa  47.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 412 aa  46.2  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  23.46 
 
 		 572 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 		 545 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  21.52 
 
 		 586 aa  45.8  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  23.15 
 
 		 468 aa  45.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  21.73 
 
 		 602 aa  45.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  21.52 
 
 		 479 aa  44.7  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>