70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2208 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 1218 aa  2532    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  44.9 
 
 		 1183 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1171 aa  482  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1182 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  75.84 
 
 		 1162 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  40.21 
 
 		 1144 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  65.06 
 
 		 1174 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  36.29 
 
 		 1131 aa  362  3e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  35.56 
 
 		 1160 aa  355  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1140 aa  346  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  33.28 
 
 		 1205 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  48.04 
 
 		 612 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  30.29 
 
 		 1180 aa  263  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  31.74 
 
 		 1167 aa  263  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  29.11 
 
 		 1219 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1241 aa  207  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1125 aa  198  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1270 aa  172  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  25 
 
 		 1324 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  31.31 
 
 		 706 aa  158  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1359 aa  155  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1497 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1430 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1141 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1162 aa  112  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  32.86 
 
 		 731 aa  112  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1174 aa  106  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1484 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  29 
 
 		 1154 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  27.11 
 
 		 309 aa  95.5  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1425 aa  95.5  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1107 aa  95.1  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1154 aa  91.3  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  24.07 
 
 		 950 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1129 aa  84.7  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  27.6 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  34.04 
 
 		 882 aa  66.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1178 aa  62.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  25 
 
 		 1326 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1177 aa  56.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.43 
 
 		 1170 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  30.83 
 
 		 481 aa  53.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  27.23 
 
 		 300 aa  53.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4996  hypothetical protein  33.01 
 
 		 302 aa  53.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  33.7 
 
 		 1338 aa  50.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  38 
 
 		 416 aa  49.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1881  hypothetical protein  53.45 
 
 		 143 aa  48.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  34.82 
 
 		 1301 aa  48.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  33.33 
 
 		 1358 aa  48.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  21.32 
 
 		 494 aa  48.5  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  30.34 
 
 		 929 aa  48.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1426 aa  48.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1858  hypothetical protein  29.93 
 
 		 211 aa  48.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275455  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1188 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1120 aa  48.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  38.96 
 
 		 974 aa  48.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  36.49 
 
 		 478 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01630  calcineurin temperature suppressor Cts1  45.45 
 
 		 827 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  29.85 
 
 		 1239 aa  47  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  25.9 
 
 		 506 aa  46.6  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  30.39 
 
 		 1706 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31000  predicted protein  31.17 
 
 		 1451 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0221973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  20.73 
 
 		 494 aa  45.8  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  36.84 
 
 		 746 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  26.72 
 
 		 524 aa  45.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1339 aa  45.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.13 
 
 		 629 aa  45.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.19 
 
 		 1194 aa  45.1  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  32.1 
 
 		 914 aa  45.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  32.43 
 
 		 477 aa  45.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>