140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2072 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  68.04 
 
 		 97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  61.86 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  61.86 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  58.76 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  56.7 
 
 		 98 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  56.7 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  58.33 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  57.73 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  52.58 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  52.69 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  57.89 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  56.25 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  56.52 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  44 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  49.43 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  43.88 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  51.65 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  39.8 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  39.56 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.96 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  44.74 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  39.56 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  40.43 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  41.49 
 
 		 98 aa  66.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  40.66 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  41.05 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  43.68 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  38.64 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  44.05 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  38.95 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  37.93 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  38.2 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  65.85 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  36.17 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38.3 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  39.8 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  35.11 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  40.26 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  37.11 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  42.67 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  37.93 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  36.26 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  36.67 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.85 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  40.22 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  43.9 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  32.94 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  38.27 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  47.14 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  51.02 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.48 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  36.78 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  32.14 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  34.69 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  36.49 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  34.38 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  37.04 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  27.85 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  40.24 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  32.61 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  33.7 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  38.57 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  33.72 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  29.27 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  34.18 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  43.48 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  29.03 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  32.47 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  34.21 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>