More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2022 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  57.85 
 
 
582 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  99.32 
 
 
586 aa  1181    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  57.04 
 
 
575 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  72.31 
 
 
586 aa  841    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  57.9 
 
 
592 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  100 
 
 
586 aa  1189    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  54.2 
 
 
595 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  52.59 
 
 
581 aa  581  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 
560 aa  342  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  38 
 
 
562 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.82 
 
 
555 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 
561 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 
562 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 
557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 
554 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.06 
 
 
562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.78 
 
 
577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33 
 
 
579 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.83 
 
 
579 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  32.67 
 
 
579 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.83 
 
 
579 aa  306  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 
567 aa  306  9.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.83 
 
 
579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.83 
 
 
583 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.83 
 
 
579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.83 
 
 
583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.83 
 
 
579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 
565 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 
579 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 
554 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  33.39 
 
 
561 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 
573 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 
565 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 
555 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.21 
 
 
573 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.11 
 
 
579 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  35.8 
 
 
568 aa  296  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.8 
 
 
580 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.22 
 
 
561 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 
551 aa  293  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.7 
 
 
555 aa  293  7e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 
572 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.95 
 
 
552 aa  289  9e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  31.99 
 
 
556 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 
566 aa  287  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 
570 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 
557 aa  283  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 
574 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 
572 aa  282  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 
564 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
559 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.72 
 
 
572 aa  277  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 
553 aa  277  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 
553 aa  277  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  32.94 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.56 
 
 
553 aa  274  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 
556 aa  273  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.41 
 
 
558 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 
552 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.92 
 
 
553 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.58 
 
 
586 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 
557 aa  270  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 
559 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 
567 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 
556 aa  269  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  31.06 
 
 
561 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 
601 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 
599 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 
553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 
553 aa  267  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 
579 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 
605 aa  266  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
558 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 
589 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.22 
 
 
553 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 
553 aa  264  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.34 
 
 
554 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.18 
 
 
560 aa  263  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.57 
 
 
553 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.53 
 
 
558 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.25 
 
 
554 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  31.61 
 
 
578 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.97 
 
 
552 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.53 
 
 
608 aa  260  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  32.02 
 
 
579 aa  260  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.34 
 
 
565 aa  259  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 
556 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  34.17 
 
 
555 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 
565 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.68 
 
 
553 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  33.78 
 
 
555 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.14 
 
 
557 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 
558 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  30.8 
 
 
552 aa  257  5e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.47 
 
 
554 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.95 
 
 
559 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.95 
 
 
559 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.51 
 
 
553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>