27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1916 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1916  XisI protein  100 
 
 
113 aa  234  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00487175  normal  0.6255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1892  XisI protein  94.69 
 
 
113 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1884  XisI protein  64.6 
 
 
113 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3320  XisI protein-like  59.29 
 
 
113 aa  137  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0534365  normal  0.223328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2269  XisI protein-like  54.39 
 
 
114 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2014  XisI protein  47.79 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0149  XisI protein  47.32 
 
 
111 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0145  XisI protein  47.32 
 
 
111 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400952  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1458  fdxN element excision controlling factor XisI  41.6 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200426  hitchhiker  0.0000247963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0527  FdxN element excision controlling factor protein  43.36 
 
 
111 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.142004  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4222  XisI protein  40.91 
 
 
116 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3825  XisI protein-like  40.71 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3313  fdxN element excision controlling factor protein  39.82 
 
 
111 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291559  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2661  XisI protein  38.94 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4367  XisI protein  42.34 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2205  XisI protein  44.35 
 
 
113 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00320905  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3443  XisI protein  39.64 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247573  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5305  XisI protein  38.39 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2556  XisI protein  38.94 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5179  XisI protein  35.71 
 
 
115 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0976064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2630  XisI protein  38.89 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3080  XisI protein  38.05 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417644  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4436  XisI protein  36.61 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0239  XisI protein  34.21 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114397  normal  0.0125664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1546  XisI protein  34.21 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145625  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2358  XisI protein-like  55.81 
 
 
47 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.448056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0282  XisI protein  25.64 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>