More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1573 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1549  DNA polymerase III subunit delta'  99.69 
 
 
319 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1573  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
319 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3164  DNA polymerase III subunit delta'  62.34 
 
 
318 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3025  DNA polymerase III subunit delta'  59.94 
 
 
317 aa  376  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  57.28 
 
 
320 aa  350  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1565  DNA polymerase III subunit delta'  57.32 
 
 
320 aa  342  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257181  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0094  DNA polymerase III subunit delta'  56.45 
 
 
311 aa  308  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0993  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.47 
 
 
325 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.124546  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26481  DNA polymerase III subunit delta'  46.42 
 
 
326 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2379  DNA polymerase III subunit delta'  49.03 
 
 
314 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0313  DNA polymerase III subunit delta'  45.78 
 
 
318 aa  242  6e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1495  DNA polymerase III subunit delta'  40.37 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0414246  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  39.44 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01431  DNA polymerase III subunit delta'  38.99 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.519241 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0084  DNA polymerase III subunit delta'  37.27 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5515  DNA polymerase III delta prime subunit  37.26 
 
 
306 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01571  DNA polymerase III subunit delta'  33.66 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.499348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0131  DNA polymerase III subunit delta'  29.17 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.363524  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01481  DNA polymerase III subunit delta'  30.23 
 
 
320 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0343458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  35.38 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01461  DNA polymerase III subunit delta'  31.23 
 
 
320 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.9 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.88 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  32.16 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.67 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  32.41 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.29 
 
 
320 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.19 
 
 
343 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.19 
 
 
345 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.09 
 
 
320 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.73 
 
 
326 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  32.64 
 
 
326 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  32 
 
 
320 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.84 
 
 
344 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000288191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.96 
 
 
358 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.25 
 
 
320 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.25 
 
 
320 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.7 
 
 
373 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000014932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.94 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.8 
 
 
589 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.32 
 
 
343 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.82 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.64 
 
 
383 aa  97.8  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.95 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.27 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0993  DNA polymerase III subunit delta'  33.48 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0961  DNA polymerase III subunit delta'  33.48 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.220444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  31.09 
 
 
337 aa  95.9  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0821  DNA polymerase III subunit delta'  29.41 
 
 
347 aa  95.9  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.114263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  31.67 
 
 
389 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.95 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.36 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1961  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.36 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  33.19 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  34.02 
 
 
327 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0008  DNA polymerase III gamma-tau subunits  29.74 
 
 
669 aa  92.4  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.167579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.58 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.34 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  33.51 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  32.47 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  33.51 
 
 
327 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  29.9 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  27.12 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  33.51 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0028  DNA-directed DNA polymerase  30.91 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0584307 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.57 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5416  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.51 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  32.84 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  32.99 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.22 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  29.71 
 
 
565 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1761  DNA polymerase III subunits gamma/tau  33.45 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  29.71 
 
 
565 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.35 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.22 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.97 
 
 
338 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  30.8 
 
 
320 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.96 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.04 
 
 
613 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000104981  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  29.79 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.4 
 
 
455 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.95 
 
 
578 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2078  DNA polymerase III subunit delta'  31.37 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.37 
 
 
485 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1940  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.45 
 
 
318 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.792182  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.51 
 
 
586 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.05 
 
 
339 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  32.84 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.76 
 
 
688 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.51 
 
 
584 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1583  DNA polymerase III subunit delta'  30.52 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0104741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  32.14 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.59 
 
 
540 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.3 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1640  DNA polymerase III subunit delta'  31.33 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>