106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1506 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1479  permease  100 
 
 
343 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  100 
 
 
343 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  68.97 
 
 
341 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  61.72 
 
 
350 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  59.88 
 
 
350 aa  394  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  58.97 
 
 
362 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  56.52 
 
 
335 aa  381  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  61.18 
 
 
336 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  38.07 
 
 
328 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  38.07 
 
 
328 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  42.02 
 
 
325 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  34.42 
 
 
298 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  35.51 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  35.2 
 
 
298 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  35.2 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  35.51 
 
 
298 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.46 
 
 
300 aa  176  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  37.65 
 
 
318 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.69 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  33.94 
 
 
288 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  33.44 
 
 
346 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  37.58 
 
 
318 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  37.31 
 
 
323 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  31.23 
 
 
297 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  34.11 
 
 
358 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  33.02 
 
 
312 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  30.63 
 
 
297 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  27.55 
 
 
524 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  28.62 
 
 
371 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  32.23 
 
 
524 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  27.55 
 
 
325 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  27.55 
 
 
325 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.61 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  28.17 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  27.86 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  27.24 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  27.24 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  29.34 
 
 
342 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  31.44 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  29.94 
 
 
288 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  31.12 
 
 
332 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  32.8 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  27.8 
 
 
364 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  32.55 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  32.59 
 
 
357 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  32.45 
 
 
350 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  46.08 
 
 
365 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  42.86 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.75 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  20.36 
 
 
451 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  21.65 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  20.06 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  29.77 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  20.06 
 
 
433 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  41.57 
 
 
620 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  21.55 
 
 
402 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  31.07 
 
 
342 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  20.71 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  21.78 
 
 
352 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  23.48 
 
 
633 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  25.82 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  31.07 
 
 
300 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  23.78 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.32 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  26.03 
 
 
293 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  22.08 
 
 
367 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.51 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  24.49 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  31.31 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  21.11 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  22.05 
 
 
474 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  33.68 
 
 
373 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  30.11 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  21.04 
 
 
611 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.21 
 
 
296 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  23.63 
 
 
475 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  22.22 
 
 
315 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  30.36 
 
 
300 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  30.36 
 
 
300 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  20.34 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  31.25 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  31.25 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  24.29 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.31 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  23.83 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  38.46 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  31.25 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  24.57 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  31.25 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  32.29 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  31.25 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  20.36 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  31.25 
 
 
346 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  31.25 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>