38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1354 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  100 
 
 		 417 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  40.1 
 
 		 388 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  38.49 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  33.33 
 
 		 168 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  33.33 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  33.33 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  31.85 
 
 		 198 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  31.78 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  36.96 
 
 		 148 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  29.92 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.22 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  30.4 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  31.16 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  30.43 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.46 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  33.07 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.46 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.46 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.19 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  31.62 
 
 		 126 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.04 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  27.48 
 
 		 199 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  25.76 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  26.97 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  26.72 
 
 		 154 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  26.98 
 
 		 197 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  26.47 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  26.77 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  24.81 
 
 		 133 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  28.32 
 
 		 142 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1261  hypothetical protein  28.3 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  23.81 
 
 		 152 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  22.22 
 
 		 154 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>