More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1317 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 
308 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  93.51 
 
 
308 aa  587  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  58.67 
 
 
308 aa  348  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  53.49 
 
 
301 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  56.95 
 
 
293 aa  328  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  55.44 
 
 
291 aa  315  7e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  50.49 
 
 
299 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  48.65 
 
 
294 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  43.03 
 
 
323 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  42.52 
 
 
315 aa  225  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  40.79 
 
 
307 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  40.52 
 
 
309 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.49 
 
 
307 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.94 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.56 
 
 
300 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 
302 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.5 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 
297 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  41.5 
 
 
305 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38.94 
 
 
305 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.87 
 
 
294 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  41.01 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 
307 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1642  tRNA pseudouridine synthase B  37.85 
 
 
283 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  40.99 
 
 
314 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  35.82 
 
 
307 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  39.13 
 
 
301 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  36.17 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  41.94 
 
 
293 aa  198  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  36.52 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  35.82 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  39.93 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  49.07 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  41.41 
 
 
294 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  42.06 
 
 
304 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  37.23 
 
 
294 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  38.72 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 
294 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.04 
 
 
303 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  41.76 
 
 
304 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  40.52 
 
 
300 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  40.65 
 
 
300 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  43.2 
 
 
292 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1119  tRNA pseudouridine synthase B  41.11 
 
 
318 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.717594  normal  0.307912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  38.3 
 
 
305 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  35.37 
 
 
309 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  42.57 
 
 
303 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  41.37 
 
 
280 aa  186  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1212  tRNA pseudouridine synthase B  40.37 
 
 
318 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.193622  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  37.37 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  35.79 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  37.72 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  39.26 
 
 
298 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  35.79 
 
 
304 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  38.7 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  40.47 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  40.71 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  39.69 
 
 
344 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 
299 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2771  tRNA pseudouridine synthase B  36.42 
 
 
307 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  39.64 
 
 
310 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  39.64 
 
 
310 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 
309 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  38.13 
 
 
293 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  38.13 
 
 
293 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01305  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  38.97 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  37.79 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2029  tRNA pseudouridine synthase B  37.15 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  43.66 
 
 
299 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  37.83 
 
 
310 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2026  tRNA pseudouridine synthase B  37.65 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  42.97 
 
 
295 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  37.83 
 
 
310 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  39.69 
 
 
293 aa  178  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  42.59 
 
 
306 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  39.01 
 
 
306 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  45.28 
 
 
289 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  36.7 
 
 
305 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  43.87 
 
 
297 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  38.39 
 
 
322 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  39.29 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  42.08 
 
 
310 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  36.67 
 
 
305 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  36.67 
 
 
305 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>