149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1220 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  64.68 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  61.11 
 
 		 203 aa  257  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  61.11 
 
 		 203 aa  257  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  48.76 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  43.5 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  43 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  41 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  41 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  40.22 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  36.55 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  28.65 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  31.12 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  29.17 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  30.89 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.11 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  30.21 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  30.2 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  29.56 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  28.88 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  30.2 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  31.37 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  31.37 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  29.7 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  31.37 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  29.21 
 
 		 229 aa  97.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  29.21 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  27.45 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  27.45 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  28.37 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  28.22 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  30.33 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  29.29 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  30.15 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  30.15 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  27.04 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  30.15 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  27.04 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  31.96 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  29.65 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  27.64 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  29.15 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  26.29 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  24.34 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  28.65 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  24.24 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  24.24 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  25.77 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  25.77 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  25.77 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  29.65 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  49.18 
 
 		 74 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  51.79 
 
 		 74 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1602  DNA binding domain protein, excisionase family  48.28 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.200885  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  51.06 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1745  DNA binding domain-containing protein  51.06 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1619  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  25 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1938  excisionase family DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  55.81 
 
 		 94 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  35.44 
 
 		 128 aa  52.4  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  24.58 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  24.64 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6401  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.566174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0517  DNA binding domain protein, excisionase family  48.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  23.3 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 134 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3543  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000932058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0733  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  23.59 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  22.47 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2159  DNA binding domain protein, excisionase family  47.83 
 
 		 72 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4926  merR family DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08990  DNA-binding protein, excisionase family  40.38 
 
 		 72 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 		 77 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  24.14 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34060  DNA-binding protein, excisionase family  40 
 
 		 76 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.910239  normal  0.267084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5979  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  42.22 
 
 		 75 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 168 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  43.75 
 
 		 707 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 		 129 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0693  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 		 79 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0633565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0258  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 74 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0161  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 69 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4091  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 90 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0170  DNA binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 69 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.996607  hitchhiker  0.0018108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4511  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 88 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.812065  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2905  DNA binding domain protein, excisionase family  43.18 
 
 		 71 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.616527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  59.38 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  51.22 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>