More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1106 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  44.03 
 
 		 935 aa  743    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  68.23 
 
 		 951 aa  1296    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  75.45 
 
 		 932 aa  1469    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49779  predicted protein  41.37 
 
 		 918 aa  674    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.894811  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  47 
 
 		 980 aa  766    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  67.48 
 
 		 944 aa  1283    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  41.96 
 
 		 946 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  83.88 
 
 		 935 aa  1617    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  67.59 
 
 		 943 aa  1290    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  67.27 
 
 		 942 aa  1278    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1643  preprotein translocase, SecA subunit  42.92 
 
 		 998 aa  715    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  49.15 
 
 		 958 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  42.07 
 
 		 953 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  75.13 
 
 		 930 aa  1449    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  69.01 
 
 		 937 aa  1335    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  69.84 
 
 		 934 aa  1345    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  66.88 
 
 		 943 aa  1299    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  73.68 
 
 		 948 aa  1441    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  49.84 
 
 		 896 aa  867    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 		 946 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  42.36 
 
 		 947 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  74.76 
 
 		 930 aa  1450    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  43.05 
 
 		 958 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  42.04 
 
 		 946 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  67.23 
 
 		 945 aa  1312    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  42.95 
 
 		 951 aa  669    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1058  preprotein translocase subunit SecA  45.49 
 
 		 869 aa  719    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.981267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  99.89 
 
 		 935 aa  1915    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  46.11 
 
 		 945 aa  753    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  67.8 
 
 		 943 aa  1283    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 935 aa  1919    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  75.88 
 
 		 936 aa  1469    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  49.26 
 
 		 957 aa  870    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  50.59 
 
 		 888 aa  852    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  57.36 
 
 		 932 aa  1086    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  42.63 
 
 		 950 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  49.39 
 
 		 1067 aa  743    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2105  cyclic nucleotide-binding protein  45.09 
 
 		 1007 aa  756    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.877046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  67.16 
 
 		 943 aa  1305    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  59.17 
 
 		 894 aa  629  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  57.87 
 
 		 899 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  59.92 
 
 		 886 aa  622  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  58.03 
 
 		 897 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  59 
 
 		 873 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  56.14 
 
 		 899 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  58.56 
 
 		 872 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  57.5 
 
 		 917 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 896 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  58.65 
 
 		 903 aa  601  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  56.29 
 
 		 993 aa  601  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  55.93 
 
 		 910 aa  600  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  58.79 
 
 		 896 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  56.39 
 
 		 912 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  57.12 
 
 		 903 aa  595  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  57.44 
 
 		 954 aa  592  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  56.51 
 
 		 897 aa  592  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  54.81 
 
 		 962 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  56.95 
 
 		 908 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  57.74 
 
 		 994 aa  588  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  56.57 
 
 		 866 aa  587  1e-166  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  56.85 
 
 		 1009 aa  588  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  55.3 
 
 		 934 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  56.37 
 
 		 904 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  54.62 
 
 		 944 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  57.93 
 
 		 845 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  57.66 
 
 		 955 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  57.14 
 
 		 909 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  54.44 
 
 		 962 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  57.65 
 
 		 859 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  54.36 
 
 		 962 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  56.19 
 
 		 909 aa  582  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  55.28 
 
 		 914 aa  579  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  55.6 
 
 		 864 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  56.51 
 
 		 975 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  54.8 
 
 		 934 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  53.78 
 
 		 992 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 		 913 aa  582  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  55.49 
 
 		 916 aa  582  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  56.79 
 
 		 908 aa  581  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  55.77 
 
 		 912 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  55.88 
 
 		 910 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  54.43 
 
 		 932 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  55.28 
 
 		 914 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  57.39 
 
 		 796 aa  579  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  54.8 
 
 		 932 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  56.6 
 
 		 907 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  54.43 
 
 		 930 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  52.9 
 
 		 918 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3807  preprotein translocase, SecA subunit  57.25 
 
 		 895 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0963816  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  57.76 
 
 		 834 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  54.24 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  56.45 
 
 		 912 aa  579  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  58.15 
 
 		 787 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  53.49 
 
 		 919 aa  578  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>