More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0983 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0956  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0983  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0475372 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1108  nucleoid protein Hbs  59.55 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0932961  normal  0.770831 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13741  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  56.18 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0318  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1610  nucleoid protein Hbs  57.61 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148246  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0015  Histone-like DNA-binding protein  57.3 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3159  histone family protein DNA-binding protein  53.68 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.124819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1767  nucleoid protein Hbs  57.3 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  53.68 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  55.68 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0648  non-specific DNA-binding protein HBsu  56.63 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  55.68 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  52.27 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  53.33 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  51.09 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  52.27 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  52.27 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  51.55 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  48.35 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  51.14 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0907  transcriptional regulator HU subunit beta  50.56 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  49.43 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  51.16 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  47.19 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  48.31 
 
 		 90 aa  90.5  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  48.31 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1227  HU family DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000165625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0682  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.651291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  50.56 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0658  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  50.57 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>