More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0920 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  922    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  80.09 
 
 
462 aa  768    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  79.82 
 
 
457 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  79.05 
 
 
463 aa  756    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  922    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.87 
 
 
471 aa  737    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  82.97 
 
 
464 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0973  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.29 
 
 
390 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00533761  normal  0.376368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  52.53 
 
 
475 aa  488  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.8 
 
 
459 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.23 
 
 
450 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  49.22 
 
 
446 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  48.21 
 
 
427 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.33 
 
 
443 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.78 
 
 
438 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.22 
 
 
460 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.67 
 
 
436 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.82 
 
 
453 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  48.9 
 
 
440 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  47.89 
 
 
435 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  47.89 
 
 
436 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.45 
 
 
438 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  48.06 
 
 
453 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.67 
 
 
436 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  47.88 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.59 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  46.83 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  48.27 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.46 
 
 
445 aa  412  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  48.01 
 
 
435 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  48.12 
 
 
434 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  47.02 
 
 
440 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  47.3 
 
 
454 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  47.35 
 
 
445 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  47.9 
 
 
434 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  47.68 
 
 
433 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  47.14 
 
 
450 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.35 
 
 
448 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  48.34 
 
 
434 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.24 
 
 
434 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.79 
 
 
434 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  47.36 
 
 
450 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.02 
 
 
447 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  47.36 
 
 
439 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.14 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.57 
 
 
457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  46.9 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  46.46 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.23 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.24 
 
 
447 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  47.02 
 
 
438 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.8 
 
 
444 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  47.45 
 
 
434 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  47.02 
 
 
438 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.83 
 
 
467 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.15 
 
 
440 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  47.01 
 
 
434 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.32 
 
 
442 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  47.24 
 
 
438 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  46.92 
 
 
456 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.83 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  48.13 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.13 
 
 
463 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  46.77 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  48.13 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  46 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  48.12 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  46.7 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.7 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  48.36 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  48.14 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  46.56 
 
 
443 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.91 
 
 
454 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.35 
 
 
449 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  46.24 
 
 
440 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.4 
 
 
467 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.1 
 
 
457 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  46.92 
 
 
438 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  48.02 
 
 
463 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.15 
 
 
452 aa  398  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  45.16 
 
 
470 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  45.58 
 
 
438 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.56 
 
 
433 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.13 
 
 
446 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.02 
 
 
440 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  45.59 
 
 
454 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  47.38 
 
 
447 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.71 
 
 
466 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  45.92 
 
 
441 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.02 
 
 
447 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  44.62 
 
 
440 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  44.52 
 
 
466 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  45.47 
 
 
442 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.68 
 
 
437 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  45.49 
 
 
470 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  44.91 
 
 
445 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.25 
 
 
466 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.35 
 
 
438 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.55 
 
 
482 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.49 
 
 
470 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>