More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0891 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  99.13 
 
 
346 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
346 aa  708    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  62.61 
 
 
353 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  63.86 
 
 
341 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  62.57 
 
 
349 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  58.16 
 
 
327 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  51.77 
 
 
384 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  53.74 
 
 
380 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  57.14 
 
 
378 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  57.73 
 
 
362 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  56.57 
 
 
378 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  55.4 
 
 
373 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  54.46 
 
 
366 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  47.93 
 
 
379 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  47.66 
 
 
372 aa  345  8e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  52.1 
 
 
349 aa  334  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  49.09 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  47.48 
 
 
344 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  45.94 
 
 
362 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  45.1 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  45.93 
 
 
357 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  66.18 
 
 
379 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  45.12 
 
 
338 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  53.17 
 
 
383 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 
364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  37.57 
 
 
360 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  39.88 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.63 
 
 
323 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 
335 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 
324 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  38.89 
 
 
369 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 
336 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 
323 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 
323 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  36.18 
 
 
323 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 
332 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.43 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.41 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 
328 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 
328 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.99 
 
 
347 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.97 
 
 
353 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.36 
 
 
343 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.24 
 
 
350 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  36.23 
 
 
339 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.51 
 
 
320 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.59 
 
 
326 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  35.84 
 
 
324 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.88 
 
 
388 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.84 
 
 
323 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.07 
 
 
349 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.92 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.39 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  31.97 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.04 
 
 
353 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.57 
 
 
345 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.25 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 
346 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 
349 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.73 
 
 
320 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.71 
 
 
361 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.82 
 
 
394 aa  185  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  31.44 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  31.46 
 
 
405 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  30.83 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  30.51 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 
406 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.72 
 
 
354 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  34.54 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  30.57 
 
 
395 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.06 
 
 
358 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  30.25 
 
 
527 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  30.57 
 
 
395 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  30.57 
 
 
422 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  30.59 
 
 
401 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  44.44 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  30.31 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  30.05 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 
408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 
377 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  30.05 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.44 
 
 
363 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  43.52 
 
 
457 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  31.03 
 
 
406 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  31.64 
 
 
376 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  30.41 
 
 
406 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  33.72 
 
 
316 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  30.49 
 
 
415 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  38.06 
 
 
352 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.02 
 
 
316 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  30.26 
 
 
401 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  30.93 
 
 
400 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
384 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  30.93 
 
 
400 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  43.01 
 
 
460 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  43 
 
 
493 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 
322 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  30.05 
 
 
395 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  33.24 
 
 
347 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>