20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0773 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  99.12 
 
 
114 aa  229  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  70.59 
 
 
114 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  66.02 
 
 
121 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  38.64 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  36.26 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  38.1 
 
 
301 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  40.26 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  37.8 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.24 
 
 
307 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.4 
 
 
326 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  32 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.33 
 
 
328 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  31.36 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.16 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0032  cobalt transport protein CbiN  29.36 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  58.06 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.66 
 
 
343 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  31.68 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  32.67 
 
 
98 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>