60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0681 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  100 
 
 
353 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  80.45 
 
 
352 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  35.58 
 
 
368 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  33.42 
 
 
369 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  21.08 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  25.28 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  38.95 
 
 
430 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25.72 
 
 
406 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  40.51 
 
 
515 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  30.08 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  35.9 
 
 
455 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  34.27 
 
 
410 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  35.56 
 
 
440 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  40.98 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  47.83 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  34.44 
 
 
218 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  33.01 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  38.82 
 
 
203 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  36.36 
 
 
540 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.63 
 
 
382 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  44.44 
 
 
464 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  33.01 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  22.63 
 
 
382 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  35.87 
 
 
422 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  31.07 
 
 
482 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  31.31 
 
 
577 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  34.78 
 
 
423 aa  49.7  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  29.79 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  34.62 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
495 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  45.45 
 
 
454 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2345  ea59 protein  32.93 
 
 
516 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.41 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  35.8 
 
 
427 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  22.73 
 
 
659 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  35.79 
 
 
445 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 
1403 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  26.85 
 
 
464 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  41.1 
 
 
708 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  36.47 
 
 
427 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  27.03 
 
 
736 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  38.89 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  26.07 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.79 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  33.75 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  31.52 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  34.18 
 
 
421 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  37.29 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.67 
 
 
548 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  29.13 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  37.5 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  43.4 
 
 
415 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  36.56 
 
 
1227 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  39.02 
 
 
478 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  31.82 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  41.38 
 
 
476 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  34.55 
 
 
666 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  34.21 
 
 
985 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.98 
 
 
708 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  36.49 
 
 
1202 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>