125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0540 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  100 
 
 
348 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  99.71 
 
 
348 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  47.04 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  37.87 
 
 
347 aa  195  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  32.13 
 
 
1085 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  37.25 
 
 
755 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  35.93 
 
 
760 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  36.84 
 
 
772 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  37.25 
 
 
766 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  36.84 
 
 
765 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  36.84 
 
 
542 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  36.84 
 
 
779 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  35.93 
 
 
760 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  36.44 
 
 
766 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.03 
 
 
1266 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  34.56 
 
 
772 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  35 
 
 
531 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  38.1 
 
 
995 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  29.2 
 
 
993 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  28.83 
 
 
994 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.12 
 
 
1088 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.81 
 
 
1070 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.81 
 
 
1070 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  31.06 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  26.81 
 
 
1112 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  34.4 
 
 
1012 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  31.12 
 
 
858 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  28.29 
 
 
954 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  29.32 
 
 
1011 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  29.96 
 
 
421 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  33.87 
 
 
1351 aa  106  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  32.85 
 
 
718 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  28.88 
 
 
400 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.41 
 
 
877 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  29.44 
 
 
399 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  28.57 
 
 
400 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  33.65 
 
 
789 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  33.65 
 
 
789 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  26.32 
 
 
399 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.11 
 
 
1052 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  33.78 
 
 
565 aa  96.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  30.8 
 
 
467 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  27.97 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  32.82 
 
 
355 aa  94  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  30.85 
 
 
498 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  31.75 
 
 
279 aa  89.4  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  29.82 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  38.94 
 
 
587 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  32.11 
 
 
692 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  30.41 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  32.06 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  26.75 
 
 
1263 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.6 
 
 
1107 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.23 
 
 
1024 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.67 
 
 
863 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  28.57 
 
 
935 aa  70.1  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.16 
 
 
892 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  28.92 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  27.27 
 
 
1231 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.9 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.62 
 
 
867 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.11 
 
 
1086 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  35.96 
 
 
197 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.85 
 
 
1091 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  29.41 
 
 
1780 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  23.41 
 
 
539 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.73 
 
 
482 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.72 
 
 
508 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.65 
 
 
886 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  38.14 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  36.94 
 
 
205 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.85 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  28.67 
 
 
776 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  26.99 
 
 
528 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.37 
 
 
1041 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92844  predicted protein  25.81 
 
 
255 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67948  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  33.67 
 
 
165 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  26.71 
 
 
474 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  23.39 
 
 
2132 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  30.77 
 
 
757 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  24.77 
 
 
535 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  25.37 
 
 
765 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  25.87 
 
 
2491 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  34.18 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  25 
 
 
621 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  25.1 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  27.92 
 
 
1335 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  28.31 
 
 
1744 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  30.18 
 
 
1395 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  30.56 
 
 
523 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0953  hypothetical protein  24.45 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  31.15 
 
 
1290 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3343  hypothetical protein  33.04 
 
 
238 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.960237  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.11 
 
 
1344 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  30 
 
 
1749 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.55 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  29.41 
 
 
1106 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  28.77 
 
 
581 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  24.38 
 
 
523 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
464 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>