28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0469 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  100 
 
 
91 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  98.9 
 
 
91 aa  176  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  74.71 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  62.03 
 
 
80 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  50.54 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  61.43 
 
 
87 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  48.75 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  50 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  47.37 
 
 
86 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  45.56 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  45.56 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  42.31 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  48.31 
 
 
89 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  45.33 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  46.15 
 
 
86 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  38.64 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  35.16 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  31.52 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  35.23 
 
 
89 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  35.42 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  31.25 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  31.11 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  31.33 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  31.33 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  31.25 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  32.53 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  31.87 
 
 
84 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  30 
 
 
87 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>