97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0443 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 
666 aa  1357    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  55.88 
 
 
641 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 
666 aa  1357    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  40.84 
 
 
533 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  41.93 
 
 
574 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  38.97 
 
 
639 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  39.58 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  38.78 
 
 
551 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  39.26 
 
 
586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  39.26 
 
 
586 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  35.53 
 
 
581 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  35.53 
 
 
581 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  33.94 
 
 
591 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  37.4 
 
 
563 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  34.21 
 
 
593 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  33.48 
 
 
531 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  35.63 
 
 
550 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  42.82 
 
 
645 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  42 
 
 
632 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  32.49 
 
 
529 aa  276  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  34.47 
 
 
622 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  31.1 
 
 
581 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  32.73 
 
 
624 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  31.97 
 
 
550 aa  242  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  33 
 
 
604 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  31.19 
 
 
539 aa  240  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  30.66 
 
 
658 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  31.8 
 
 
530 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  32.79 
 
 
491 aa  233  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  30.65 
 
 
542 aa  230  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  28.91 
 
 
600 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  34.71 
 
 
572 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  30.71 
 
 
571 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  32.6 
 
 
643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  55.91 
 
 
543 aa  197  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  57.99 
 
 
531 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  54.84 
 
 
548 aa  194  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  27.39 
 
 
589 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.29 
 
 
508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  52.33 
 
 
518 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  29.48 
 
 
510 aa  174  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  29.24 
 
 
606 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  41.15 
 
 
578 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  47.24 
 
 
629 aa  163  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  41.46 
 
 
543 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  42.68 
 
 
555 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  45.27 
 
 
475 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  45.27 
 
 
561 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  50.29 
 
 
513 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  46.32 
 
 
528 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  35.69 
 
 
518 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  41.98 
 
 
531 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  50.29 
 
 
500 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  48.89 
 
 
524 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  48.59 
 
 
514 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  43.72 
 
 
544 aa  147  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  43.62 
 
 
188 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  38.19 
 
 
568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  43.01 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  34.16 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  34.16 
 
 
262 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  46.56 
 
 
261 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  31.65 
 
 
515 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  30.67 
 
 
450 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  31.97 
 
 
515 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  39.39 
 
 
485 aa  71.6  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  38.14 
 
 
946 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.47 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.96 
 
 
449 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  34.26 
 
 
932 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  33.61 
 
 
416 aa  61.6  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  32.98 
 
 
255 aa  57.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  34.29 
 
 
919 aa  57.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  33.05 
 
 
186 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  29.51 
 
 
361 aa  54.3  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  37.04 
 
 
415 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  33.33 
 
 
673 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  38.33 
 
 
343 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  26.43 
 
 
784 aa  51.6  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  34.78 
 
 
426 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  44.07 
 
 
575 aa  48.9  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 
1036 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  35.71 
 
 
424 aa  48.5  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  44.44 
 
 
1821 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  37.5 
 
 
506 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.95 
 
 
330 aa  48.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  32.54 
 
 
414 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  35.85 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  30.21 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  33.72 
 
 
432 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  29.35 
 
 
441 aa  45.8  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  38.89 
 
 
400 aa  44.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  38.89 
 
 
400 aa  44.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  41.51 
 
 
548 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  39.13 
 
 
468 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.35 
 
 
558 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  30.11 
 
 
432 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>