More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0248 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  74.64 
 
 
210 aa  330  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  73.33 
 
 
210 aa  328  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  73.21 
 
 
210 aa  322  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  69.52 
 
 
212 aa  317  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  72.12 
 
 
210 aa  311  4e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  2.05733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  65.38 
 
 
210 aa  294  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  58.1 
 
 
211 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  58.1 
 
 
211 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  57.14 
 
 
211 aa  261  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  54.76 
 
 
211 aa  254  9e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  54.76 
 
 
212 aa  251  5e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  54.76 
 
 
211 aa  250  9e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  55.72 
 
 
210 aa  243  2e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  55.22 
 
 
210 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  55.22 
 
 
210 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  54.73 
 
 
210 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 
206 aa  196  2e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  46.53 
 
 
251 aa  195  5e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  49.07 
 
 
206 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  45.97 
 
 
207 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.02 
 
 
206 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 
207 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 
207 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 
207 aa  189  3e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 
208 aa  188  6e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  46.92 
 
 
206 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  46.8 
 
 
208 aa  185  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
207 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 
221 aa  181  8e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  45.93 
 
 
207 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  178  5e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.06 
 
 
207 aa  178  5e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  48.76 
 
 
209 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.34 
 
 
223 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 
204 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 
204 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  42.38 
 
 
207 aa  173  1e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
205 aa  173  1e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  43.6 
 
 
206 aa  173  2e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
208 aa  173  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  42.11 
 
 
207 aa  171  7e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.81 
 
 
207 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.06 
 
 
207 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.79 
 
 
221 aa  166  3e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 
208 aa  165  4e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 
207 aa  164  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  164  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 
207 aa  163  2e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 
214 aa  162  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  40.87 
 
 
207 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.18 
 
 
207 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 
207 aa  162  4e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 
207 aa  162  4e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.18 
 
 
206 aa  161  5e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 
206 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4547  50S ribosomal protein L4  45.55 
 
 
200 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0714588  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  38.28 
 
 
207 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0627  ribosomal protein L4  45.55 
 
 
200 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  6.98865e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  40.44 
 
 
223 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  47.75 
 
 
204 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.92469e-07  hitchhiker  1.64794e-06 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
208 aa  160  2e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 
206 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  3.84651e-12  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  45.83 
 
 
200 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.16803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.14 
 
 
209 aa  157  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 
206 aa  157  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.69503e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 
201 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  4.27281e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 
207 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  40.76 
 
 
207 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00446  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 
201 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000113118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  43.15 
 
 
206 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.29639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5078  50S ribosomal protein L4  43.98 
 
 
200 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  6.47229e-08  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  41.79 
 
 
202 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  44.79 
 
 
200 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.74601e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  40.87 
 
 
207 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0470  50S ribosomal protein L4  43.13 
 
 
201 aa  155  5e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.63865e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  44.9 
 
 
206 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 
205 aa  154  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  44.27 
 
 
200 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00731  50S ribosomal protein L4  45.31 
 
 
200 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 
200 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.57 
 
 
215 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 
206 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 
200 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  43.98 
 
 
200 aa  152  3e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  7.4471e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 
201 aa  152  3e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 
201 aa  152  3e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.87067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  43.98 
 
 
200 aa  152  3e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  43.98 
 
 
200 aa  152  3e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  1.14619e-09  normal  0.070368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>