More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0091 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0091  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
294 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0094  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  95.92 
 
 
294 aa  584  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1563  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  68.75 
 
 
295 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3653  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  62.85 
 
 
294 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2554  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  58.68 
 
 
292 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.31 
 
 
294 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1967  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.99 
 
 
308 aa  147  2e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1255  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.47 
 
 
293 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.463201  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3226  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.93 
 
 
300 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.09 
 
 
305 aa  134  2e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0477  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.47 
 
 
279 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  6.5602e-12  decreased coverage  3.61225e-09 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1084  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.32 
 
 
283 aa  131  2e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0125965  normal  0.0422522 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1426  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.15 
 
 
288 aa  128  1e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.41063  hitchhiker  0.00349813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.04 
 
 
303 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.61 
 
 
297 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.85 
 
 
307 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.10972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0551  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.07 
 
 
307 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4815  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.45 
 
 
299 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.324066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.15 
 
 
298 aa  121  1e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.58 
 
 
327 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1313  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.5 
 
 
276 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4601  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.85 
 
 
282 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3878  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 
304 aa  115  1e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2145  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.9 
 
 
297 aa  114  1e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.292783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0452  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 
304 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4174  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.24 
 
 
306 aa  114  2e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0462  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 
304 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.15 
 
 
306 aa  113  4e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0509  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.66 
 
 
301 aa  113  4e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3709  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.32 
 
 
309 aa  113  4e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0328  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.08 
 
 
278 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.06 
 
 
281 aa  112  8e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217368  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0589  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.08 
 
 
285 aa  112  8e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0766528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0436  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.3 
 
 
304 aa  112  1e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1216  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.49 
 
 
296 aa  108  8e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2507  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.25 
 
 
272 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.31 
 
 
473 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.89 
 
 
306 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1385  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.65 
 
 
306 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.17 
 
 
294 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
286 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08032  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02240)  26.17 
 
 
314 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.019625  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.85 
 
 
295 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6598  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.3 
 
 
321 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456488 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5752  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.55 
 
 
321 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6116  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.55 
 
 
321 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.86 
 
 
285 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3163  NAD dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
306 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4291  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.27 
 
 
298 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.86 
 
 
281 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.53 
 
 
333 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.351702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.41 
 
 
294 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.41 
 
 
294 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.9 
 
 
307 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0850  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.04 
 
 
314 aa  99  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.44 
 
 
287 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0794  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  26.43 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.32 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  8.98814e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7602  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.28 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02230  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0219255  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0049  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.14 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  26.43 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1177  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.36 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2525  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.08 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0122  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.24 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1969  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.26 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.569693  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4446  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.07 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.34 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.46 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0637  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.16 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.618272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.55 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4428  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.2 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23 
 
 
281 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1984  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.6 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.52 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1055  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.91 
 
 
301 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148895  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.57 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.15 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3934  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.74 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.1 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.91 
 
 
730 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6087  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.68 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25518  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.78 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547009  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.09 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2597  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.49 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.47 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.54 
 
 
279 aa  89  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27418  hitchhiker  0.000721041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345391  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.79 
 
 
723 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.55 
 
 
287 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98546e-06 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1493  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.62 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0953  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.09 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5849  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.94 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.91 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.65 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1207  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.08 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  21.82 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.49825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.09546e-13 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.18 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.657644  hitchhiker  0.00910437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.81 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>