More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0082 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  97.87 
 
 
423 aa  862  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
423 aa  877  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  34.79 
 
 
465 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  35.69 
 
 
362 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.08195e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  34.72 
 
 
361 aa  217  3e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  35.34 
 
 
370 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.68758e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
438 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  34.18 
 
 
323 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.85 
 
 
313 aa  167  3e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  34.67 
 
 
313 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.69 
 
 
395 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.75 
 
 
334 aa  166  1e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  34.51 
 
 
632 aa  165  2e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
310 aa  164  4e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.35 
 
 
328 aa  162  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 
395 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  32.85 
 
 
468 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  32.46 
 
 
335 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.69653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
318 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  31.86 
 
 
368 aa  159  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.42 
 
 
357 aa  159  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.73164e-05 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 
328 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  33.54 
 
 
324 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.64 
 
 
335 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.38 
 
 
451 aa  157  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
399 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  33.85 
 
 
338 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  30.95 
 
 
393 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  1.35592e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  34.65 
 
 
359 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  8.8158e-06 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.97 
 
 
356 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  1.04958e-07 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
373 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  1.72243e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
727 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
412 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
329 aa  150  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  33.84 
 
 
416 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  9.39229e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  32.21 
 
 
662 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
375 aa  149  1e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 
337 aa  148  2e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
402 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.44499e-07  unclonable  2.27525e-10 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
417 aa  146  8e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  30.28 
 
 
371 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 
319 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  44.07 
 
 
406 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  37.62 
 
 
437 aa  142  1e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  34.69 
 
 
417 aa  142  1e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
342 aa  142  1e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  29.87 
 
 
308 aa  142  1e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
379 aa  142  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  33.73 
 
 
331 aa  142  2e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  29.91 
 
 
327 aa  140  5e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.16 
 
 
489 aa  140  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  32.83 
 
 
320 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
414 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
416 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  35.19 
 
 
350 aa  135  1e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  31.11 
 
 
419 aa  135  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  2.23127e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.79 
 
 
400 aa  135  2e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  30.41 
 
 
440 aa  134  2e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.17 
 
 
398 aa  135  2e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  4.36024e-06 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  31.9 
 
 
305 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
319 aa  133  6e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.63 
 
 
350 aa  133  7e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
418 aa  132  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
418 aa  132  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
386 aa  132  1e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 
415 aa  132  1e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.37 
 
 
405 aa  131  2e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.36169e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  31.6 
 
 
418 aa  131  2e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
389 aa  131  2e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  2.03506e-05  hitchhiker  4.0976e-05 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
318 aa  131  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
434 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.63 
 
 
350 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
354 aa  130  4e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.9 
 
 
388 aa  130  5e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
320 aa  130  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
336 aa  129  7e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 
652 aa  129  9e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  30.86 
 
 
352 aa  129  1e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 
417 aa  128  2e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
325 aa  128  2e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
329 aa  128  2e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  1.9493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 
365 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
454 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.28 
 
 
345 aa  126  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
371 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  31.66 
 
 
313 aa  126  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  31.13 
 
 
426 aa  126  8e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  31.16 
 
 
323 aa  126  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
313 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  34.32 
 
 
406 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  27.21 
 
 
437 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.59 
 
 
415 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.61 
 
 
387 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.59 
 
 
359 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 
311 aa  124  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  29.9 
 
 
425 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.89 
 
 
350 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
371 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
362 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30.25 
 
 
460 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>